90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0407 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0407  pilus assembly protein, PilO  100 
 
 		 207 aa  421  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0292492  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0405  pilus assembly protein, PilO  73.43 
 
 		 207 aa  314  5e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66640  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  73.43 
 
 		 207 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362732  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5130  type IV pilus biogenesis protein PilO  72.95 
 
 		 207 aa  311  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.818389  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5779  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  73.43 
 
 		 207 aa  311  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0544  pilus assembly protein, PilO  73.3 
 
 		 206 aa  299  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45280  Pilus assembly protein  69.08 
 
 		 206 aa  271  4.0000000000000004e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0828  pilus assembly protein, PilO  52 
 
 		 203 aa  207  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0249  pilus assembly protein, PilO  55.08 
 
 		 202 aa  186  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0337  pilus assembly protein PilO  44.68 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4268  pilus assembly protein, PilO  45.74 
 
 		 206 aa  175  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.449559 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0469  type IV pilus biogenesis protein PilO  46.84 
 
 		 198 aa  174  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429204  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3371  type IV pilus biogenesis protein PilO  47.09 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0372  pilus assembly protein, PilO  45.74 
 
 		 205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.116717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0210  pilus assembly protein, PilO  43.92 
 
 		 207 aa  172  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0216288  hitchhiker  0.0081665 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0258  pilus assembly protein, PilO  46.28 
 
 		 206 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2689  hypothetical protein  45.45 
 
 		 204 aa  171  6.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000030695  hitchhiker  0.00743225 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4006  Pilus assembly protein PilO  45.74 
 
 		 208 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4116  pilus assembly protein PilO  45.21 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4087  pilus assembly protein PilO  44.68 
 
 		 207 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4205  pilus assembly protein PilO  44.68 
 
 		 207 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3897  pilus assembly protein, PilO  45.74 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000635484  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3701  pilus assembly protein, PilO  45.74 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.318823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0244  pilus assembly protein, PilO  45.74 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3709  pilus assembly protein, PilO  45.21 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00761204  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3026  Pilus assembly protein PilO  44.74 
 
 		 195 aa  165  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0235  pilus assembly protein PilO  46.81 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.613869  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0283  type IV pilus biogenesis protein PilO  43.62 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0610  pilus assembly protein, PilO  41.54 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.12175  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0991  Tfp pilus assembly protein PilO  43.52 
 
 		 199 aa  154  9e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0960  Tfp pilus assembly protein PilO  42.86 
 
 		 199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00513  type IV pilus biogenesis protein PilO  43.92 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0212  pilus assembly protein, PilO  40.74 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0669  pilus assembly protein, PilO  41.4 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.823764  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0204  type IV pilus assembly membrane transmembrane protein  40.74 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.273451 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0327  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  46.23 
 
 		 212 aa  148  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2459  pilus assembly protein, PilO  46.84 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2171  pilus assembly protein, PilO  39.57 
 
 		 243 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21566  normal  0.257999 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1881  type IV pilus biogenesis  38.5 
 
 		 242 aa  142  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00049939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0277  Pilus assembly protein PilO  42.78 
 
 		 193 aa  141  9e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.747419 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02353  fimbrial assembly membrane protein  38.5 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.658699  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3238  Pilus assembly protein PilO  39.5 
 
 		 218 aa  138  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.674567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2757  pilus assembly protein, PilO  39.15 
 
 		 194 aa  135  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1858  fimbrial assembly membrane protein  39.69 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0178525  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0836  Pilus assembly protein PilO  40.41 
 
 		 224 aa  134  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1787  pilus assembly protein PilO  39 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.521607  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0885  Pilus assembly protein PilO  35.61 
 
 		 217 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0737  fimbrial assembly protein PilO, putative  35.61 
 
 		 217 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1142  Pilus assembly protein PilO  35.92 
 
 		 227 aa  131  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1939  Pilus assembly protein PilO  36.27 
 
 		 204 aa  131  9e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5579  pilus assembly protein PilO  38.3 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697556 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3405  pilus assembly protein PilO  37.44 
 
 		 238 aa  125  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.152027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0020  pilus assembly protein, PilO  36.17 
 
 		 223 aa  122  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0732  pilus assembly protein, PilO  35.11 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0701  Pilus assembly protein PilO  35.11 
 
 		 224 aa  122  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0998  pilus assembly protein, PilO  37.56 
 
 		 226 aa  122  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3133  pilus assembly protein, PilO  35.64 
 
 		 222 aa  117  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0160  type IV pilus biogenesis protein PilO  34.74 
 
 		 190 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.546604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2921  pilus assembly protein, PilO  35.11 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0674  pilus assembly protein, PilO  35.11 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.214156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3270  pilus assembly protein PilO  36.17 
 
 		 223 aa  114  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3111  fimbrial assembly protein  33.67 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.125549 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3251  Pilus assembly protein PilO  35.11 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0783  pilus assembly protein, PilO  35.11 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2904  Pilus assembly protein PilO  34.04 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2973  fimbrial type-4 assembly membrane transmembrane protein  34.57 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00031  fimbrial assembly protein PilO  30.69 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002324  type IV pilus biogenesis protein PilO  30.46 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.10237  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2718  fimbrial assembly protein PilO  30.85 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2209  putative fimbrial assembly protein PilO  30.48 
 
 		 199 aa  95.5  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00186051  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1812  pilus assembly protein, PilO  32.84 
 
 		 199 aa  92.8  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1548  Pilus assembly protein PilO  31.98 
 
 		 199 aa  90.5  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0973  pilus assembly protein, PilO  32.67 
 
 		 198 aa  89.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.572943 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2667  Pilus assembly protein PilO  31.36 
 
 		 198 aa  87.8  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000121155 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2030  type IV pilus biogenesis protein PilO  33.55 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.72092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1642  Pilus assembly protein PilO  32.87 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0677  type IV pilus biogenesis protein PilO  27.27 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.211189  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0994  pilus assembly protein, PilO  30.07 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0643  type IV pilus biogenesis protein PilO  28.41 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0677  Pilus assembly protein PilO  26.7 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0331  pilus assembly protein PilO  29.59 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0217389  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0539  pilus assembly protein, PilO  28.4 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2136  pilus assembly protein, PilO-like  29.79 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000460184  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0688  type IV pilus biogenesis protein PilO  27.78 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.507617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3251  hypothetical protein  28.89 
 
 		 177 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2201  Tfp pilus assembly protein PilO-like protein  28.06 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0385  type IV pili biogenesis protein PilP  23.08 
 
 		 338 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1982  Tfp pilus assembly protein PilO-like protein  26.73 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0105796  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0398  Tfp pilus assembly protein PilO-like protein  21.03 
 
 		 469 aa  42.4  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029887 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0250  hypothetical protein  25.68 
 
 		 221 aa  42  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.802054  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>