49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0385 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0385  type IV pili biogenesis protein PilP  100 
 
 		 338 aa  669    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4954  hypothetical protein  50.75 
 
 		 333 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5081  type IV pili biogenesis protein  50 
 
 		 338 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5131  type IV pili biogenesis protein PilP  47.88 
 
 		 336 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5778  type 4 fimbrial biogenesis protein PilP  40.96 
 
 		 173 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45270  Pilus assembly protein  43.9 
 
 		 174 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66630  type 4 fimbrial biogenesis protein PilP  40.96 
 
 		 174 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0408  pilus assembly protein, PilQ  36.14 
 
 		 174 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0021286  normal  0.0991539 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0837  Pilus assembly protein PilP  35.37 
 
 		 174 aa  53.5  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5129  type IV pilus biogenesis protein PilP  38.55 
 
 		 175 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0406  pilus assembly protein, PilQ  37.35 
 
 		 175 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0545  pilus assembly protein, PilQ  34.94 
 
 		 175 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0405  pilus assembly protein, PilO  20.48 
 
 		 207 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5130  type IV pilus biogenesis protein PilO  21.08 
 
 		 207 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.818389  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1857  fimbrial assembly protein  35.8 
 
 		 176 aa  50.1  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00682106  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1786  pilus assembly protein PilP  35.8 
 
 		 176 aa  50.1  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1143  Pilus assembly protein PilP  30.08 
 
 		 180 aa  50.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3110  fimbrial assembly protein  35.11 
 
 		 181 aa  49.3  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.114808 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3404  pilus assembly protein PilP  35.37 
 
 		 186 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.392117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0999  pilus assembly protein, PilQ  34.94 
 
 		 181 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.435204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5578  pilus assembly protein PilP  36.14 
 
 		 182 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694592 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0961  Tfp pilus assembly protein PilP  30.12 
 
 		 194 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0992  Tfp pilus assembly protein PilP  30.12 
 
 		 194 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3250  Pilus assembly protein PilP  27.2 
 
 		 181 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0250  pilus assembly protein, PilQ  34.57 
 
 		 192 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.624121  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0829  pilus assembly protein, PilQ  37.21 
 
 		 180 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0469  type IV pilus biogenesis protein PilO  25.37 
 
 		 198 aa  47.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429204  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3237  Pilus assembly protein PilP  37.04 
 
 		 177 aa  47  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.947409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2458  type IV pilus assembly protein PilP  28.46 
 
 		 176 aa  46.6  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.977907  normal  0.948644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0407  pilus assembly protein, PilO  23.57 
 
 		 207 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0292492  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0019  pilus assembly protein, PilQ  33.73 
 
 		 180 aa  46.2  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0611  pilus assembly protein, PilQ  37.04 
 
 		 186 aa  46.2  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0576908  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02352  fimbrial assembly protein  37.04 
 
 		 163 aa  46.2  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688013  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4005  Pilus assembly protein PilP  40.24 
 
 		 171 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4115  pilus assembly protein PilP  40.24 
 
 		 171 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0895824  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0733  pilus assembly protein, PilQ  33.73 
 
 		 183 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0702  Pilus assembly protein PilP  33.73 
 
 		 183 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4204  pilus assembly protein PilP  40.24 
 
 		 171 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4086  pilus assembly protein PilP  40.24 
 
 		 171 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0737  fimbrial assembly protein PilO, putative  25 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0885  Pilus assembly protein PilO  25 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5779  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  23.08 
 
 		 207 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2922  pilus assembly protein, PilQ  33.33 
 
 		 180 aa  44.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002325  type IV pilus biogenesis protein PilP  35.44 
 
 		 171 aa  43.9  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.089507  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0328  type 4 fimbrial biogenesis protein PilP  33.33 
 
 		 180 aa  43.9  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.871784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66640  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  25.83 
 
 		 207 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3896  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.02 
 
 		 171 aa  42.7  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00151123  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0675  pilus assembly protein, PilQ  35 
 
 		 183 aa  42.7  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.14172 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0974  putative type IV pilus assembly protein PilP  29.09 
 
 		 182 aa  42.4  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.462293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>