75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3110 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3110  fimbrial assembly protein  100 
 
 
181 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.114808 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3404  pilus assembly protein PilP  68.94 
 
 
186 aa  231  5e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.392117 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0675  pilus assembly protein, PilQ  55.93 
 
 
183 aa  207  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.14172 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1143  Pilus assembly protein PilP  55 
 
 
180 aa  203  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2922  pilus assembly protein, PilQ  57.93 
 
 
180 aa  201  6e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0784  pilus assembly protein, PilQ  53.04 
 
 
183 aa  197  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0233715  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0999  pilus assembly protein, PilQ  57.5 
 
 
181 aa  187  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.435204  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5578  pilus assembly protein PilP  50.56 
 
 
182 aa  184  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.694592 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0702  Pilus assembly protein PilP  50.86 
 
 
183 aa  177  8e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0733  pilus assembly protein, PilQ  50.86 
 
 
183 aa  177  8e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128887  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0019  pilus assembly protein, PilQ  50 
 
 
180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3250  Pilus assembly protein PilP  38.12 
 
 
181 aa  134  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562736  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2903  Pilus assembly protein PilP  38.12 
 
 
181 aa  134  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.820012  normal  0.0834769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0837  Pilus assembly protein PilP  37.5 
 
 
174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2972  fimbrial type-4 assembly lipoprotein  36.26 
 
 
181 aa  125  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242531  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0213  pilus assembly protein, PilQ  38.73 
 
 
181 aa  120  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94525  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3269  pilus assembly protein PilQ  39.62 
 
 
179 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2458  type IV pilus assembly protein PilP  40.24 
 
 
176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.977907  normal  0.948644 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0205  type IV pilus assembly protein PilP  39.07 
 
 
166 aa  114  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.272301 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3132  pilus assembly protein, PilQ  39.87 
 
 
178 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5778  type 4 fimbrial biogenesis protein PilP  32.57 
 
 
173 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66630  type 4 fimbrial biogenesis protein PilP  32.77 
 
 
174 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0406  pilus assembly protein, PilQ  33.9 
 
 
175 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5129  type IV pilus biogenesis protein PilP  32.2 
 
 
175 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0545  pilus assembly protein, PilQ  33.14 
 
 
175 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1940  Pilus assembly protein PilP  33.53 
 
 
183 aa  95.1  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0328  type 4 fimbrial biogenesis protein PilP  34.3 
 
 
180 aa  94.4  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.871784  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02352  fimbrial assembly protein  32.5 
 
 
163 aa  93.2  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688013  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3027  Pilus assembly protein PilP  30.77 
 
 
186 aa  92  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0829  pilus assembly protein, PilQ  32.22 
 
 
180 aa  91.7  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2688  type 4 fimbrial biogenesis protein PilP  31.52 
 
 
164 aa  89.4  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000848303  normal  0.0164816 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45270  Pilus assembly protein  30.99 
 
 
174 aa  88.6  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0470  type IV pilus biogenesis protein PilP  29.94 
 
 
184 aa  88.6  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0408  pilus assembly protein, PilQ  35.67 
 
 
174 aa  87  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0021286  normal  0.0991539 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1857  fimbrial assembly protein  31.45 
 
 
176 aa  87  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00682106  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3370  type IV pilus biogenesis protein PilP  31.52 
 
 
172 aa  86.3  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0198252  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1786  pilus assembly protein PilP  30.19 
 
 
176 aa  86.7  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0250  pilus assembly protein, PilQ  32.8 
 
 
192 aa  86.3  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.624121  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4115  pilus assembly protein PilP  30.23 
 
 
171 aa  85.5  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0895824  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3237  Pilus assembly protein PilP  32.26 
 
 
177 aa  85.9  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.947409  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0611  pilus assembly protein, PilQ  29.67 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0576908  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4086  pilus assembly protein PilP  29.65 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4204  pilus assembly protein PilP  29.65 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2208  putative fimbrial assembly protein PilP  31.76 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00448572  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0278  Pilus assembly protein PilP  30.39 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.912251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4267  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.220429 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00512  putative Type IV pilus biogenesis protein PilP  27.78 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4005  Pilus assembly protein PilP  31.25 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0992  Tfp pilus assembly protein PilP  31.68 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0284  type IV pilus biogenesis protein PilP  29.17 
 
 
171 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0373  pilus assembly protein, PilQ  29.76 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.145937  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0961  Tfp pilus assembly protein PilP  31.25 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0211  pilus assembly protein, PilQ  28.05 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00519508  hitchhiker  0.0081665 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0668  pilus assembly protein, PilQ  26.9 
 
 
177 aa  77  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.56514  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0259  pilus assembly protein, PilQ  29.27 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0161  type IV pilus biogenesis protein PilP  29.19 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.420826  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3708  pilus assembly protein, PilQ  28.66 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00553172  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0236  pilus assembly protein PilP  28.57 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511899  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3896  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.75 
 
 
171 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00151123  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3700  pilus assembly protein, PilQ  28.75 
 
 
171 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0245  pilus assembly protein, PilQ  28.75 
 
 
171 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.979467 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0338  pilus assembly protein PilP  27.78 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00030  fimbrial assembly protein PilP  29.05 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1880  type IV pilus assembly  28.82 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000158762  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2170  pilus assembly protein, PilQ  37.89 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0954419  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0884  Pilus assembly protein PilP  26.37 
 
 
182 aa  61.6  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0736  type 4 fimbrial biogenesis protein PilP, putative  26.37 
 
 
182 aa  61.6  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2758  pilus assembly protein, PilQ  36.47 
 
 
181 aa  60.8  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.912715  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002325  type IV pilus biogenesis protein PilP  27.95 
 
 
171 aa  57  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.089507  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5131  type IV pili biogenesis protein PilP  36.25 
 
 
336 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0385  type IV pili biogenesis protein PilP  35.11 
 
 
338 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4954  hypothetical protein  35 
 
 
333 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5081  type IV pili biogenesis protein  35 
 
 
338 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2719  fimbrial assembly protein PilP  21.23 
 
 
172 aa  45.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2200  PilP  27.82 
 
 
180 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>