36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0974 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0974  putative type IV pilus assembly protein PilP  100 
 
 		 182 aa  359  9e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.462293 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2029  putative lipoprotein  56.45 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1813  hypothetical protein  46.89 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1549  putative type IV pilus assembly protein PilP  50.58 
 
 		 186 aa  121  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0995  putative type IV pilus assembly protein PilP  38.98 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2666  putative type IV pilus assembly protein PilP  47.34 
 
 		 183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000211304 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1643  putative type IV pilus assembly protein PilP  40.43 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2135  pilus assembly protein, PilP-like  31.82 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000761065  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2208  putative fimbrial assembly protein PilP  30.77 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00448572  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2200  PilP  28.49 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0678  hypothetical protein  30.7 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0644  hypothetical protein  29.82 
 
 		 177 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0678  hypothetical protein  29.57 
 
 		 177 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.30381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0689  hypothetical protein  24.14 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0330  hypothetical protein  32.61 
 
 		 326 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177354  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3269  pilus assembly protein PilQ  33.98 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1981  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  48.9  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0314098  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3250  Pilus assembly protein PilP  27.47 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2903  Pilus assembly protein PilP  27.47 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.820012  normal  0.0834769 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002325  type IV pilus biogenesis protein PilP  34 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.089507  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00030  fimbrial assembly protein PilP  26.9 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2719  fimbrial assembly protein PilP  25.28 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0124  hypothetical protein  30.58 
 
 		 264 aa  45.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.64704  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0961  Tfp pilus assembly protein PilP  30.53 
 
 		 194 aa  45.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0992  Tfp pilus assembly protein PilP  30.53 
 
 		 194 aa  45.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3132  pilus assembly protein, PilQ  32.04 
 
 		 178 aa  45.1  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0837  Pilus assembly protein PilP  30.7 
 
 		 174 aa  44.7  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0385  type IV pili biogenesis protein PilP  29.09 
 
 		 338 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1857  fimbrial assembly protein  25.74 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00682106  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1786  pilus assembly protein PilP  25.74 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2758  pilus assembly protein, PilQ  26.36 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.912715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0611  pilus assembly protein, PilQ  25 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0576908  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0545  pilus assembly protein, PilQ  27.01 
 
 		 175 aa  42.4  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2972  fimbrial type-4 assembly lipoprotein  26.82 
 
 		 181 aa  41.6  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0829  pilus assembly protein, PilQ  23.81 
 
 		 180 aa  41.2  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2458  type IV pilus assembly protein PilP  27.5 
 
 		 176 aa  41.6  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.977907  normal  0.948644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>