29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2135 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2135  pilus assembly protein, PilP-like  100 
 
 		 177 aa  355  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000761065  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2029  putative lipoprotein  40.87 
 
 		 182 aa  95.1  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1813  hypothetical protein  31.43 
 
 		 183 aa  84.7  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2200  PilP  35.16 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0974  putative type IV pilus assembly protein PilP  36.21 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.462293 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0644  hypothetical protein  38.66 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0678  hypothetical protein  37.82 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0678  hypothetical protein  37.82 
 
 		 177 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.30381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0689  hypothetical protein  37.82 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0995  putative type IV pilus assembly protein PilP  33.06 
 
 		 177 aa  72  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1643  putative type IV pilus assembly protein PilP  35.61 
 
 		 188 aa  70.9  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2666  putative type IV pilus assembly protein PilP  34.52 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000211304 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1549  putative type IV pilus assembly protein PilP  34.52 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0328  type 4 fimbrial biogenesis protein PilP  25.7 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.871784  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1981  hypothetical protein  35.65 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0314098  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0330  hypothetical protein  44.44 
 
 		 326 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177354  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00030  fimbrial assembly protein PilP  27.32 
 
 		 171 aa  48.5  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0611  pilus assembly protein, PilQ  28.7 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0576908  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002325  type IV pilus biogenesis protein PilP  31.36 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.089507  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0250  pilus assembly protein, PilQ  25.29 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.624121  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1857  fimbrial assembly protein  29.9 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00682106  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1786  pilus assembly protein PilP  27.83 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0124  hypothetical protein  27.19 
 
 		 264 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.64704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1020  lipoprotein, putative  25.25 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2758  pilus assembly protein, PilQ  27.03 
 
 		 181 aa  41.6  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.912715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0128  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.825416  hitchhiker  0.0000282917 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2208  putative fimbrial assembly protein PilP  25.22 
 
 		 172 aa  41.2  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00448572  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2458  type IV pilus assembly protein PilP  26.83 
 
 		 176 aa  41.2  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.977907  normal  0.948644 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0205  type IV pilus assembly protein PilP  25.69 
 
 		 166 aa  40.8  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>