24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2029 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2029  putative lipoprotein  100 
 
 		 182 aa  362  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0974  putative type IV pilus assembly protein PilP  55.38 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.462293 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1813  hypothetical protein  45.95 
 
 		 183 aa  155  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0995  putative type IV pilus assembly protein PilP  40.45 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1643  putative type IV pilus assembly protein PilP  40 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2135  pilus assembly protein, PilP-like  35.16 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000761065  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2666  putative type IV pilus assembly protein PilP  40.7 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000211304 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1549  putative type IV pilus assembly protein PilP  45.67 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2200  PilP  34.17 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1981  hypothetical protein  32.79 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0314098  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2208  putative fimbrial assembly protein PilP  36.71 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00448572  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002325  type IV pilus biogenesis protein PilP  37.18 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.089507  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2719  fimbrial assembly protein PilP  25.56 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0330  hypothetical protein  37.04 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177354  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00030  fimbrial assembly protein PilP  35.9 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0678  hypothetical protein  29.59 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0678  hypothetical protein  28.57 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.30381  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0644  hypothetical protein  28.57 
 
 		 177 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0689  hypothetical protein  26.85 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0124  hypothetical protein  31.91 
 
 		 264 aa  48.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.64704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0611  pilus assembly protein, PilQ  28.46 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0576908  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2758  pilus assembly protein, PilQ  27.83 
 
 		 181 aa  44.7  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.912715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0837  Pilus assembly protein PilP  28.57 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2688  type 4 fimbrial biogenesis protein PilP  34.15 
 
 		 164 aa  42  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000848303  normal  0.0164816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>