25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1981 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1981  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  332  1e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0314098  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2200  PilP  42.86 
 
 		 180 aa  122  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2029  putative lipoprotein  32.79 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1813  hypothetical protein  35.83 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0995  putative type IV pilus assembly protein PilP  34.17 
 
 		 177 aa  60.5  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0689  hypothetical protein  31.45 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0974  putative type IV pilus assembly protein PilP  34.17 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.462293 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0644  hypothetical protein  31.25 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0678  hypothetical protein  32.03 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0678  hypothetical protein  31.25 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.30381  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2135  pilus assembly protein, PilP-like  35.65 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000761065  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1643  putative type IV pilus assembly protein PilP  33.05 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0205  type IV pilus assembly protein PilP  31.71 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272301 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002325  type IV pilus biogenesis protein PilP  33.33 
 
 		 171 aa  47.8  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.089507  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00030  fimbrial assembly protein PilP  29.89 
 
 		 171 aa  47.4  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2208  putative fimbrial assembly protein PilP  25.83 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00448572  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0736  type 4 fimbrial biogenesis protein PilP, putative  28.06 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0884  Pilus assembly protein PilP  28.06 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1857  fimbrial assembly protein  33.33 
 
 		 176 aa  44.3  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00682106  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1549  putative type IV pilus assembly protein PilP  33.33 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2666  putative type IV pilus assembly protein PilP  33.33 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000211304 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0330  hypothetical protein  44.44 
 
 		 326 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177354  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0213  pilus assembly protein, PilQ  28.81 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1786  pilus assembly protein PilP  32.26 
 
 		 176 aa  41.6  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3237  Pilus assembly protein PilP  27.5 
 
 		 177 aa  40.8  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.947409  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>