22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0330 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0330  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  640    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177354  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0995  putative type IV pilus assembly protein PilP  35.96 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2029  putative lipoprotein  37.04 
 
 		 182 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1643  putative type IV pilus assembly protein PilP  41.67 
 
 		 188 aa  52.8  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1813  hypothetical protein  40.74 
 
 		 183 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2666  putative type IV pilus assembly protein PilP  39.44 
 
 		 183 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000211304 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1857  fimbrial assembly protein  33.98 
 
 		 176 aa  50.8  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00682106  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1549  putative type IV pilus assembly protein PilP  39.44 
 
 		 186 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1786  pilus assembly protein PilP  33.98 
 
 		 176 aa  49.7  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2200  PilP  40.66 
 
 		 180 aa  49.7  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2135  pilus assembly protein, PilP-like  44.44 
 
 		 177 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000761065  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0124  hypothetical protein  33.33 
 
 		 264 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.64704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0974  putative type IV pilus assembly protein PilP  38.1 
 
 		 182 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.462293 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2208  putative fimbrial assembly protein PilP  36.36 
 
 		 172 aa  47  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00448572  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02352  fimbrial assembly protein  31.07 
 
 		 163 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688013  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1940  Pilus assembly protein PilP  31.58 
 
 		 183 aa  43.9  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3237  Pilus assembly protein PilP  30.1 
 
 		 177 aa  43.9  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.947409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45270  Pilus assembly protein  34.62 
 
 		 174 aa  43.5  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00030  fimbrial assembly protein PilP  35.29 
 
 		 171 aa  43.1  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1981  hypothetical protein  44.44 
 
 		 163 aa  42.7  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0314098  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1880  type IV pilus assembly  34.78 
 
 		 179 aa  42.7  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000158762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2758  pilus assembly protein, PilQ  29.41 
 
 		 181 aa  42.7  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.912715  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>