27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0995 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0995  putative type IV pilus assembly protein PilP  100 
 
 		 177 aa  356  9e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1643  putative type IV pilus assembly protein PilP  47.67 
 
 		 188 aa  147  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2029  putative lipoprotein  39.89 
 
 		 182 aa  121  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1813  hypothetical protein  42.05 
 
 		 183 aa  120  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1549  putative type IV pilus assembly protein PilP  42.35 
 
 		 186 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2666  putative type IV pilus assembly protein PilP  39.29 
 
 		 183 aa  104  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000211304 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0974  putative type IV pilus assembly protein PilP  38.41 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.462293 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2135  pilus assembly protein, PilP-like  33.06 
 
 		 177 aa  72  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000761065  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0689  hypothetical protein  28.57 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0678  hypothetical protein  27.87 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.30381  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0678  hypothetical protein  27.87 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0644  hypothetical protein  26.83 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1981  hypothetical protein  40.48 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0314098  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0330  hypothetical protein  35.96 
 
 		 326 aa  55.5  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177354  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2200  PilP  27.35 
 
 		 180 aa  52.4  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0611  pilus assembly protein, PilQ  29.11 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0576908  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2758  pilus assembly protein, PilQ  24.29 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.912715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00030  fimbrial assembly protein PilP  29.49 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0205  type IV pilus assembly protein PilP  27.43 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272301 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002325  type IV pilus biogenesis protein PilP  28.21 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.089507  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2688  type 4 fimbrial biogenesis protein PilP  32.81 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000848303  normal  0.0164816 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0961  Tfp pilus assembly protein PilP  27.42 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0992  Tfp pilus assembly protein PilP  27.42 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1786  pilus assembly protein PilP  29.41 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1857  fimbrial assembly protein  29.41 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00682106  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2719  fimbrial assembly protein PilP  22.16 
 
 		 172 aa  41.6  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2458  type IV pilus assembly protein PilP  31.82 
 
 		 176 aa  41.6  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.977907  normal  0.948644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>