35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0644 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0644  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  351  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0678  hypothetical protein  87.57 
 
 
177 aa  276  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0678  hypothetical protein  86.44 
 
 
177 aa  275  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.30381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0689  hypothetical protein  60.64 
 
 
180 aa  203  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429593  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2135  pilus assembly protein, PilP-like  34.73 
 
 
177 aa  81.3  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000761065  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2200  PilP  36.57 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0995  putative type IV pilus assembly protein PilP  24.7 
 
 
177 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1813  hypothetical protein  25.28 
 
 
183 aa  57.8  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1786  pilus assembly protein PilP  33.33 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66630  type 4 fimbrial biogenesis protein PilP  25.47 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0668  pilus assembly protein, PilQ  23.73 
 
 
177 aa  55.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.56514  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1857  fimbrial assembly protein  32.43 
 
 
176 aa  54.7  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00682106  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2029  putative lipoprotein  28.57 
 
 
182 aa  53.9  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5778  type 4 fimbrial biogenesis protein PilP  27.33 
 
 
173 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1643  putative type IV pilus assembly protein PilP  30.33 
 
 
188 aa  52.4  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0974  putative type IV pilus assembly protein PilP  28.83 
 
 
182 aa  51.6  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.462293 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1549  putative type IV pilus assembly protein PilP  34.94 
 
 
186 aa  51.2  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2666  putative type IV pilus assembly protein PilP  34.94 
 
 
183 aa  51.2  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000211304 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2170  pilus assembly protein, PilQ  32.76 
 
 
179 aa  51.2  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0954419  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0611  pilus assembly protein, PilQ  32.74 
 
 
186 aa  50.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0576908  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3237  Pilus assembly protein PilP  31.25 
 
 
177 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.947409  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1880  type IV pilus assembly  31.9 
 
 
179 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000158762  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1981  hypothetical protein  30.47 
 
 
163 aa  48.9  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0314098  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2688  type 4 fimbrial biogenesis protein PilP  27.03 
 
 
164 aa  48.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000848303  normal  0.0164816 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02352  fimbrial assembly protein  29.36 
 
 
163 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688013  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0205  type IV pilus assembly protein PilP  26.09 
 
 
166 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.272301 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0328  type 4 fimbrial biogenesis protein PilP  27.73 
 
 
180 aa  45.1  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.871784  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0837  Pilus assembly protein PilP  27.52 
 
 
174 aa  44.7  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0545  pilus assembly protein, PilQ  23.75 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002325  type IV pilus biogenesis protein PilP  39.34 
 
 
171 aa  41.6  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.089507  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0330  hypothetical protein  34.52 
 
 
326 aa  41.6  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177354  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2719  fimbrial assembly protein PilP  30 
 
 
172 aa  41.2  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0736  type 4 fimbrial biogenesis protein PilP, putative  27.81 
 
 
182 aa  40.8  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0884  Pilus assembly protein PilP  27.81 
 
 
182 aa  40.8  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0961  Tfp pilus assembly protein PilP  25.88 
 
 
194 aa  40.8  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>