28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0678 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0678  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  347  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0678  hypothetical protein  98.87 
 
 		 177 aa  346  1e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.30381  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0644  hypothetical protein  87.57 
 
 		 177 aa  277  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0689  hypothetical protein  64.44 
 
 		 180 aa  204  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2135  pilus assembly protein, PilP-like  32.75 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000761065  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2200  PilP  37.1 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1813  hypothetical protein  26 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0995  putative type IV pilus assembly protein PilP  27.87 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2029  putative lipoprotein  30 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1786  pilus assembly protein PilP  34.58 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1857  fimbrial assembly protein  33.64 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00682106  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0611  pilus assembly protein, PilQ  32.56 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0576908  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1981  hypothetical protein  29.86 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0314098  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1549  putative type IV pilus assembly protein PilP  36.14 
 
 		 186 aa  52  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0974  putative type IV pilus assembly protein PilP  28.95 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.462293 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2666  putative type IV pilus assembly protein PilP  36.14 
 
 		 183 aa  52  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000211304 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1643  putative type IV pilus assembly protein PilP  27.86 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1880  type IV pilus assembly  30.77 
 
 		 179 aa  47.8  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000158762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2170  pilus assembly protein, PilQ  30.91 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0954419  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02352  fimbrial assembly protein  30.69 
 
 		 163 aa  46.2  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688013  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5778  type 4 fimbrial biogenesis protein PilP  26.22 
 
 		 173 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0205  type IV pilus assembly protein PilP  27.78 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66630  type 4 fimbrial biogenesis protein PilP  24.39 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0330  hypothetical protein  35.37 
 
 		 326 aa  42.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177354  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002325  type IV pilus biogenesis protein PilP  39.34 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.089507  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0328  type 4 fimbrial biogenesis protein PilP  25.81 
 
 		 180 aa  41.6  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.871784  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2719  fimbrial assembly protein PilP  27.72 
 
 		 172 aa  41.6  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0961  Tfp pilus assembly protein PilP  25.88 
 
 		 194 aa  41.2  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>