35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1549 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1549  putative type IV pilus assembly protein PilP  100 
 
 		 186 aa  364  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2666  putative type IV pilus assembly protein PilP  85.48 
 
 		 183 aa  229  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000211304 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1813  hypothetical protein  44.79 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0974  putative type IV pilus assembly protein PilP  52.33 
 
 		 182 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.462293 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0995  putative type IV pilus assembly protein PilP  41.48 
 
 		 177 aa  121  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2029  putative lipoprotein  41.71 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1643  putative type IV pilus assembly protein PilP  40.23 
 
 		 188 aa  92.8  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2135  pilus assembly protein, PilP-like  28.8 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000761065  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0678  hypothetical protein  31.93 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0678  hypothetical protein  31.93 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.30381  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0330  hypothetical protein  39.44 
 
 		 326 aa  52  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177354  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0644  hypothetical protein  31.09 
 
 		 177 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2200  PilP  31.75 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4086  pilus assembly protein PilP  37.18 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4204  pilus assembly protein PilP  37.18 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4115  pilus assembly protein PilP  35.9 
 
 		 171 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0895824  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4005  Pilus assembly protein PilP  35.9 
 
 		 171 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0611  pilus assembly protein, PilQ  32.47 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0576908  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0689  hypothetical protein  26.89 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429593  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0328  type 4 fimbrial biogenesis protein PilP  29.91 
 
 		 180 aa  45.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.871784  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02352  fimbrial assembly protein  26.39 
 
 		 163 aa  45.4  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688013  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1786  pilus assembly protein PilP  29.41 
 
 		 176 aa  45.1  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1857  fimbrial assembly protein  28.68 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00682106  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3250  Pilus assembly protein PilP  27.52 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2903  Pilus assembly protein PilP  27.52 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.820012  normal  0.0834769 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2972  fimbrial type-4 assembly lipoprotein  29.31 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1981  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0314098  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0205  type IV pilus assembly protein PilP  27.27 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272301 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3708  pilus assembly protein, PilQ  27.78 
 
 		 172 aa  43.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00553172  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3896  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.86 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00151123  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3370  type IV pilus biogenesis protein PilP  29.49 
 
 		 172 aa  42.4  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0198252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0338  pilus assembly protein PilP  28.77 
 
 		 171 aa  41.6  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0284  type IV pilus biogenesis protein PilP  30.14 
 
 		 171 aa  41.6  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0245  pilus assembly protein, PilQ  30.86 
 
 		 171 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.979467 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3700  pilus assembly protein, PilQ  30.86 
 
 		 171 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>