38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0398 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0398  Tfp pilus assembly protein PilO-like protein  100 
 
 		 469 aa  955    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029887 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1881  type IV pilus biogenesis  27.67 
 
 		 242 aa  97.8  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00049939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2171  pilus assembly protein, PilO  26.88 
 
 		 243 aa  94.4  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21566  normal  0.257999 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2170  pilus assembly protein, PilQ  40.7 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0954419  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1880  type IV pilus assembly  40.7 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000158762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5779  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  20.95 
 
 		 207 aa  57  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002325  type IV pilus biogenesis protein PilP  40.26 
 
 		 171 aa  55.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.089507  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00030  fimbrial assembly protein PilP  37.66 
 
 		 171 aa  55.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0610  pilus assembly protein, PilO  33.94 
 
 		 216 aa  53.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.12175  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66640  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  21.21 
 
 		 207 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0405  pilus assembly protein, PilO  21.89 
 
 		 207 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0161  type IV pilus biogenesis protein PilP  38.55 
 
 		 174 aa  48.5  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.420826  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0470  type IV pilus biogenesis protein PilP  32.35 
 
 		 184 aa  47.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2719  fimbrial assembly protein PilP  25.32 
 
 		 172 aa  47.4  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0338  pilus assembly protein PilP  33.33 
 
 		 171 aa  47  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3371  type IV pilus biogenesis protein PilO  21.54 
 
 		 210 aa  47  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1940  Pilus assembly protein PilP  32.22 
 
 		 183 aa  46.6  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2758  pilus assembly protein, PilQ  31.76 
 
 		 181 aa  46.2  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.912715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3370  type IV pilus biogenesis protein PilP  32.88 
 
 		 172 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0198252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2208  putative fimbrial assembly protein PilP  36.51 
 
 		 172 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00448572  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5130  type IV pilus biogenesis protein PilO  21.03 
 
 		 207 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.818389  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0373  pilus assembly protein, PilQ  30.88 
 
 		 172 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.145937  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0284  type IV pilus biogenesis protein PilP  32.35 
 
 		 171 aa  45.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0283  type IV pilus biogenesis protein PilO  20.33 
 
 		 206 aa  45.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0249  pilus assembly protein, PilO  18.85 
 
 		 202 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4087  pilus assembly protein PilO  20.33 
 
 		 207 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0469  type IV pilus biogenesis protein PilO  25.29 
 
 		 198 aa  44.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429204  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4005  Pilus assembly protein PilP  35.8 
 
 		 171 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4205  pilus assembly protein PilO  20.33 
 
 		 207 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4267  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.1 
 
 		 171 aa  44.3  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.220429 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00513  type IV pilus biogenesis protein PilO  35.48 
 
 		 203 aa  44.3  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4115  pilus assembly protein PilP  35.8 
 
 		 171 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0895824  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0961  Tfp pilus assembly protein PilP  30.88 
 
 		 194 aa  44.3  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0278  Pilus assembly protein PilP  32.93 
 
 		 180 aa  44.3  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.912251 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4204  pilus assembly protein PilP  35.8 
 
 		 171 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4086  pilus assembly protein PilP  35.8 
 
 		 171 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0992  Tfp pilus assembly protein PilP  30.88 
 
 		 194 aa  43.9  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0235  pilus assembly protein PilO  34.55 
 
 		 206 aa  43.5  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.613869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>