91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3251 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3251  Pilus assembly protein PilO  100 
 
 		 219 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2904  Pilus assembly protein PilO  97.54 
 
 		 219 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2973  fimbrial type-4 assembly membrane transmembrane protein  86.76 
 
 		 221 aa  391  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3133  pilus assembly protein, PilO  68.47 
 
 		 222 aa  299  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3270  pilus assembly protein PilO  67.98 
 
 		 223 aa  277  9e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3405  pilus assembly protein PilO  47.64 
 
 		 238 aa  214  9e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.152027 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3111  fimbrial assembly protein  46.93 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.125549 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2921  pilus assembly protein, PilO  50.23 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0674  pilus assembly protein, PilO  48.54 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.214156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0783  pilus assembly protein, PilO  49.52 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1142  Pilus assembly protein PilO  48.19 
 
 		 227 aa  192  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0732  pilus assembly protein, PilO  47.64 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0701  Pilus assembly protein PilO  48.11 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5579  pilus assembly protein PilO  46.01 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697556 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0020  pilus assembly protein, PilO  42.18 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0212  pilus assembly protein, PilO  41.21 
 
 		 227 aa  174  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0836  Pilus assembly protein PilO  41.09 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0998  pilus assembly protein, PilO  46.92 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0204  type IV pilus assembly membrane transmembrane protein  42.36 
 
 		 205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.273451 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2459  pilus assembly protein, PilO  42.86 
 
 		 211 aa  152  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0249  pilus assembly protein, PilO  35 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02353  fimbrial assembly membrane protein  33.67 
 
 		 221 aa  122  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.658699  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0737  fimbrial assembly protein PilO, putative  33.96 
 
 		 217 aa  121  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0885  Pilus assembly protein PilO  33.96 
 
 		 217 aa  121  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3238  Pilus assembly protein PilO  31.88 
 
 		 218 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.674567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45280  Pilus assembly protein  34.81 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1787  pilus assembly protein PilO  30.29 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.521607  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5779  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  32.97 
 
 		 207 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1858  fimbrial assembly membrane protein  29.33 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0178525  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3026  Pilus assembly protein PilO  30.77 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0407  pilus assembly protein, PilO  35.11 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0292492  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0327  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  35.42 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66640  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  31.35 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362732  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5130  type IV pilus biogenesis protein PilO  34.78 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.818389  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3371  type IV pilus biogenesis protein PilO  31.4 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0544  pilus assembly protein, PilO  34.16 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0828  pilus assembly protein, PilO  29.28 
 
 		 203 aa  105  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0405  pilus assembly protein, PilO  33.54 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0469  type IV pilus biogenesis protein PilO  32.65 
 
 		 198 aa  101  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429204  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00513  type IV pilus biogenesis protein PilO  31 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0235  pilus assembly protein PilO  28.36 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.613869  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0960  Tfp pilus assembly protein PilO  33.54 
 
 		 199 aa  99.4  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0991  Tfp pilus assembly protein PilO  33.54 
 
 		 199 aa  99  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0244  pilus assembly protein, PilO  27.09 
 
 		 208 aa  98.2  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3701  pilus assembly protein, PilO  27.09 
 
 		 208 aa  98.2  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.318823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3897  pilus assembly protein, PilO  27.09 
 
 		 208 aa  98.2  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000635484  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0372  pilus assembly protein, PilO  28.08 
 
 		 205 aa  98.2  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.116717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0210  pilus assembly protein, PilO  27.05 
 
 		 207 aa  96.7  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0216288  hitchhiker  0.0081665 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0610  pilus assembly protein, PilO  31.96 
 
 		 216 aa  95.5  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.12175  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0337  pilus assembly protein PilO  27.23 
 
 		 205 aa  95.5  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4268  pilus assembly protein, PilO  27.45 
 
 		 206 aa  94.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.449559 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0331  pilus assembly protein PilO  32.02 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0217389  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0277  Pilus assembly protein PilO  34.03 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.747419 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0283  type IV pilus biogenesis protein PilO  27.32 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0669  pilus assembly protein, PilO  27.41 
 
 		 203 aa  92.8  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.823764  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4006  Pilus assembly protein PilO  27.59 
 
 		 208 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4116  pilus assembly protein PilO  27.09 
 
 		 207 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4087  pilus assembly protein PilO  27.09 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4205  pilus assembly protein PilO  27.09 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2757  pilus assembly protein, PilO  28.5 
 
 		 194 aa  91.3  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0994  pilus assembly protein, PilO  31.36 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0258  pilus assembly protein, PilO  26.49 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3709  pilus assembly protein, PilO  26.11 
 
 		 208 aa  89.4  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00761204  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0160  type IV pilus biogenesis protein PilO  29.65 
 
 		 190 aa  88.2  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.546604  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2030  type IV pilus biogenesis protein PilO  34.64 
 
 		 198 aa  88.2  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.72092  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00031  fimbrial assembly protein PilO  27.78 
 
 		 197 aa  85.1  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2689  hypothetical protein  25.38 
 
 		 204 aa  85.1  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000030695  hitchhiker  0.00743225 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1939  Pilus assembly protein PilO  29.12 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002324  type IV pilus biogenesis protein PilO  26.67 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.10237  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2667  Pilus assembly protein PilO  29.41 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000121155 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2718  fimbrial assembly protein PilO  27.07 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2171  pilus assembly protein, PilO  23.77 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21566  normal  0.257999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1548  Pilus assembly protein PilO  29.41 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2136  pilus assembly protein, PilO-like  29.76 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000460184  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1642  Pilus assembly protein PilO  34.92 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2209  putative fimbrial assembly protein PilO  26.63 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00186051  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1881  type IV pilus biogenesis  22.22 
 
 		 242 aa  75.1  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00049939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0973  pilus assembly protein, PilO  30.52 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.572943 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1812  pilus assembly protein, PilO  32.04 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0643  type IV pilus biogenesis protein PilO  31.97 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0677  type IV pilus biogenesis protein PilO  30.23 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.211189  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0677  Pilus assembly protein PilO  30.23 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0539  pilus assembly protein, PilO  27.88 
 
 		 209 aa  62  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0688  type IV pilus biogenesis protein PilO  28.57 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.507617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2201  Tfp pilus assembly protein PilO-like protein  27.84 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1471  hypothetical protein  23.35 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.229275  normal  0.300377 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1982  Tfp pilus assembly protein PilO-like protein  25.26 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0105796  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4954  hypothetical protein  26.74 
 
 		 333 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3251  hypothetical protein  26.87 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1463  Tfp pilus assembly protein PilO-like protein  24.19 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00646714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1039  hypothetical protein  25.17 
 
 		 176 aa  42.4  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>