89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0677 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0677  Pilus assembly protein PilO  100 
 
 
209 aa  418  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0677  type IV pilus biogenesis protein PilO  99.04 
 
 
209 aa  414  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.211189  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0643  type IV pilus biogenesis protein PilO  96.41 
 
 
209 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0688  type IV pilus biogenesis protein PilO  70.48 
 
 
209 aa  291  5e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.507617  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2030  type IV pilus biogenesis protein PilO  34.54 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.72092  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2667  Pilus assembly protein PilO  33.33 
 
 
198 aa  115  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000121155 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1548  Pilus assembly protein PilO  33.33 
 
 
199 aa  112  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2136  pilus assembly protein, PilO-like  41.91 
 
 
203 aa  105  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000460184  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0973  pilus assembly protein, PilO  33.51 
 
 
198 aa  105  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572943 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0994  pilus assembly protein, PilO  36.05 
 
 
201 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1642  Pilus assembly protein PilO  35.85 
 
 
201 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1812  pilus assembly protein, PilO  33.55 
 
 
199 aa  99.8  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2757  pilus assembly protein, PilO  27.32 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0407  pilus assembly protein, PilO  26.7 
 
 
207 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0292492  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0337  pilus assembly protein PilO  28.65 
 
 
205 aa  79  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0331  pilus assembly protein PilO  31.06 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0217389  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5130  type IV pilus biogenesis protein PilO  27.57 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.818389  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0405  pilus assembly protein, PilO  27.57 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0258  pilus assembly protein, PilO  27.75 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0283  type IV pilus biogenesis protein PilO  26.96 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3897  pilus assembly protein, PilO  28.78 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000635484  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3371  type IV pilus biogenesis protein PilO  28.64 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132147  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0610  pilus assembly protein, PilO  31.38 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.12175  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3701  pilus assembly protein, PilO  28.29 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.318823  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0244  pilus assembly protein, PilO  28.29 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0836  Pilus assembly protein PilO  29.61 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0020  pilus assembly protein, PilO  26.35 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0737  fimbrial assembly protein PilO, putative  25.82 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0885  Pilus assembly protein PilO  25.82 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5779  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  28.12 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66640  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  26.88 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362732  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0210  pilus assembly protein, PilO  26.34 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0216288  hitchhiker  0.0081665 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2459  pilus assembly protein, PilO  28.48 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0544  pilus assembly protein, PilO  26.49 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4268  pilus assembly protein, PilO  25.37 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.449559 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1471  hypothetical protein  32.61 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.229275  normal  0.300377 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2904  Pilus assembly protein PilO  31.01 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2973  fimbrial type-4 assembly membrane transmembrane protein  27.98 
 
 
221 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45280  Pilus assembly protein  26.14 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5579  pilus assembly protein PilO  25.97 
 
 
225 aa  68.2  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.697556 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4116  pilus assembly protein PilO  26.52 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4006  Pilus assembly protein PilO  26.29 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3251  Pilus assembly protein PilO  30.23 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0372  pilus assembly protein, PilO  26.2 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.116717  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0204  type IV pilus assembly membrane transmembrane protein  27.45 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.273451 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4087  pilus assembly protein PilO  27.92 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0674  pilus assembly protein, PilO  27.27 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.214156 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0235  pilus assembly protein PilO  25.13 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.613869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4205  pilus assembly protein PilO  27.92 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3405  pilus assembly protein PilO  28.1 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.152027 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2689  hypothetical protein  27.66 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000030695  hitchhiker  0.00743225 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0960  Tfp pilus assembly protein PilO  24.72 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3709  pilus assembly protein, PilO  24.39 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00761204  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0991  Tfp pilus assembly protein PilO  24.72 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3133  pilus assembly protein, PilO  25.64 
 
 
222 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2921  pilus assembly protein, PilO  25.51 
 
 
223 aa  63.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0828  pilus assembly protein, PilO  24.52 
 
 
203 aa  62.4  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0539  pilus assembly protein, PilO  27.27 
 
 
209 aa  61.6  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1142  Pilus assembly protein PilO  25 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0783  pilus assembly protein, PilO  26.86 
 
 
224 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3270  pilus assembly protein PilO  25.76 
 
 
223 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0998  pilus assembly protein, PilO  24.35 
 
 
226 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0277  Pilus assembly protein PilO  29.81 
 
 
193 aa  59.3  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.747419 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0250  hypothetical protein  25.86 
 
 
221 aa  58.9  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.802054  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0327  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  24.4 
 
 
212 aa  58.9  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3111  fimbrial assembly protein  29.66 
 
 
240 aa  58.5  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.125549 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0469  type IV pilus biogenesis protein PilO  23.04 
 
 
198 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429204  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0669  pilus assembly protein, PilO  26.25 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.823764  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3238  Pilus assembly protein PilO  26.06 
 
 
218 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.674567  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1982  Tfp pilus assembly protein PilO-like protein  26.92 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0105796  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0212  pilus assembly protein, PilO  22.1 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1787  pilus assembly protein PilO  28.4 
 
 
222 aa  56.2  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.521607  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0249  pilus assembly protein, PilO  22.73 
 
 
202 aa  55.5  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1858  fimbrial assembly membrane protein  24.5 
 
 
222 aa  55.1  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0178525  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3026  Pilus assembly protein PilO  25.98 
 
 
195 aa  55.1  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0732  pilus assembly protein, PilO  23.08 
 
 
224 aa  55.1  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02353  fimbrial assembly membrane protein  25 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.658699  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0701  Pilus assembly protein PilO  23.08 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1881  type IV pilus biogenesis  22.58 
 
 
242 aa  53.1  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00049939  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2171  pilus assembly protein, PilO  22.64 
 
 
243 aa  52.8  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21566  normal  0.257999 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00513  type IV pilus biogenesis protein PilO  23.78 
 
 
203 aa  51.6  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3588  hypothetical protein  22.45 
 
 
192 aa  48.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1939  Pilus assembly protein PilO  23.97 
 
 
204 aa  47.4  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2209  putative fimbrial assembly protein PilO  25.83 
 
 
199 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00186051  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00031  fimbrial assembly protein PilO  24.16 
 
 
197 aa  45.1  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2201  Tfp pilus assembly protein PilO-like protein  26.92 
 
 
205 aa  44.3  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2718  fimbrial assembly protein PilO  26.03 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002324  type IV pilus biogenesis protein PilO  20.73 
 
 
197 aa  43.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.10237  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2699  hypothetical protein  25.49 
 
 
190 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.683156  normal  0.56108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>