More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1099 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1099  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 185 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2762  lipoprotein signal peptidase  98.38 
 
 		 185 aa  360  9e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2929  lipoprotein signal peptidase  88.24 
 
 		 186 aa  252  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0877107  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2717  lipoprotein signal peptidase  53.59 
 
 		 227 aa  187  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0359  lipoprotein signal peptidase  56.33 
 
 		 158 aa  175  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0092  lipoprotein signal peptidase  59.72 
 
 		 160 aa  154  8e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.142417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4043  signal peptidase II  47.4 
 
 		 157 aa  151  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0632  lipoprotein signal peptidase  37.43 
 
 		 177 aa  94.7  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.263263  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  37.43 
 
 		 171 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0614  lipoprotein signal peptidase  35.2 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.107984 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2603  lipoprotein signal peptidase  38.79 
 
 		 171 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2326  lipoprotein signal peptidase  38.79 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1799  lipoprotein signal peptidase  42.41 
 
 		 171 aa  89  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.408205  normal  0.0603455 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  40.38 
 
 		 164 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  40.88 
 
 		 160 aa  84.7  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  37.89 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  39.02 
 
 		 165 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0392  lipoprotein signal peptidase  37.97 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.034269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2219  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3163  lipoprotein signal peptidase  38.24 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0472  lipoprotein signal peptidase  34.38 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2356  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0383384 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2861  lipoprotein signal peptidase  42.31 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978018 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  36.76 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2543  lipoprotein signal peptidase  36.76 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0457  lipoprotein signal peptidase  33.75 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  36.08 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  39.6 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1410  lipoprotein signal peptidase  37.66 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  38.06 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  35.77 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  35.77 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  35.77 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  35.77 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  35.77 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  35.77 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  35.77 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  35.77 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  34.38 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  35.77 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  35.77 
 
 		 166 aa  72  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  35.48 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0288  lipoprotein signal peptidase  31.64 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  38.06 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  35.04 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  32.52 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2206  lipoprotein signal peptidase  43.33 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.252335  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  34.31 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  34.31 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  33.58 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  34.31 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  33.8 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  34.31 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1257  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  34.38 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3258  signal peptidase II  38.26 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.802617  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  31.1 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  34.75 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  35.83 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1715  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.488769  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  36.57 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  36.57 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  36.57 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  30.86 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  30.87 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  31.16 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  34.87 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  33.59 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  29.79 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  35.1 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  30.87 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0988  lipoprotein signal peptidase  30.36 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00914153  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  35.82 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  26.53 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  39.29 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  39.29 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  31.13 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  33.82 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  34.56 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  33.83 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  32.89 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  35.61 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  31.65 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  28.57 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  31.65 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>