More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3656 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  100 
 
 		 248 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  65.77 
 
 		 231 aa  276  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  63.39 
 
 		 233 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  45.27 
 
 		 269 aa  192  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  55.16 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  48.9 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  43.3 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  45.45 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  44.64 
 
 		 227 aa  161  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  48.88 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  41.59 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  40.44 
 
 		 228 aa  144  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  44.44 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  41.63 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  40.27 
 
 		 221 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  49.56 
 
 		 225 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  39.38 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  37.28 
 
 		 224 aa  136  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  44.16 
 
 		 214 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  38.94 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  54.36 
 
 		 243 aa  131  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  40.44 
 
 		 216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  48.99 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  35.78 
 
 		 219 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3250  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 150 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  45.78 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8420  Resolvase domain protein  47.53 
 
 		 227 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875604  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  43.11 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  38.01 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  40.48 
 
 		 236 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3000  Resolvase domain  43.8 
 
 		 197 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  40.89 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  32.64 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6343  resolvase domain protein  31.66 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  41.83 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  30.8 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  35.27 
 
 		 197 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  37.14 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  35.59 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  35.59 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  35.16 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  32.89 
 
 		 227 aa  75.1  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  38.79 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  33.9 
 
 		 184 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  39.35 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  32.77 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  34.57 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  39.47 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  39.47 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  39.47 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0209  Resolvase domain  33.05 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3478  resolvase domain-containing protein  32.77 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  31.53 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  38.93 
 
 		 185 aa  68.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  37.97 
 
 		 185 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  38.26 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  34.04 
 
 		 188 aa  67  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  36.3 
 
 		 183 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  36.3 
 
 		 183 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3786  Resolvase domain  30.77 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.366578 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  36.77 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  33.62 
 
 		 380 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  37.01 
 
 		 184 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  35.93 
 
 		 185 aa  65.1  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  35.93 
 
 		 185 aa  65.1  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  32.14 
 
 		 665 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2096  resolvase domain-containing protein  38.93 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0211835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  34.46 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  33.52 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  32.51 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  33.52 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  30.61 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  30.3 
 
 		 517 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  38.26 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  33.17 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  38 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  33.96 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3748  resolvase domain-containing protein  31.23 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57685  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  36.13 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  32.98 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  30.9 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  36.13 
 
 		 215 aa  62  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  33.33 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4189  TonB-dependent receptor protein  30.83 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2482  TonB-dependent receptor protein  30.35 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  33.54 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  33.75 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  33.87 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  35.58 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  34.36 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  33.87 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  33.87 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  31.71 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  34.32 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  32.14 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  32.33 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4026  resolvase domain-containing protein  29.96 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.884346  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  35.4 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  33.97 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  35.4 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>