More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1365 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  100 
 
 		 243 aa  494  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  91.25 
 
 		 243 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  85.19 
 
 		 243 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  76.25 
 
 		 242 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  69.01 
 
 		 242 aa  360  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  67.78 
 
 		 242 aa  349  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  57.02 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  56.89 
 
 		 226 aa  258  6e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  49.1 
 
 		 249 aa  222  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  42.17 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  40.79 
 
 		 231 aa  168  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  41.84 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  37.83 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  40.79 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  43.04 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  38.63 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  41.35 
 
 		 247 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  42.99 
 
 		 242 aa  158  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  39.64 
 
 		 231 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  36 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  36.09 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  36.52 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  36.52 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  36.04 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  34.09 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  38.79 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  38.24 
 
 		 236 aa  139  4.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  42.67 
 
 		 235 aa  136  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  37.56 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6177  transport-associated  38.07 
 
 		 198 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  41.67 
 
 		 217 aa  108  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  35.62 
 
 		 149 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  36.49 
 
 		 348 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  32.73 
 
 		 339 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  35.53 
 
 		 152 aa  95.5  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.75 
 
 		 338 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  32.89 
 
 		 232 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  32.47 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  34.93 
 
 		 339 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  33.33 
 
 		 241 aa  92  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  37.93 
 
 		 332 aa  92  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  34.87 
 
 		 201 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  36.42 
 
 		 147 aa  90.5  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  36.11 
 
 		 132 aa  90.1  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  32.46 
 
 		 227 aa  88.2  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  36.11 
 
 		 152 aa  88.6  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  31.22 
 
 		 201 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  33.48 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  32.45 
 
 		 153 aa  87.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 152 aa  87.4  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  29.61 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  33.12 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  31.34 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  31.39 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  35.04 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  31.72 
 
 		 153 aa  81.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  31.33 
 
 		 154 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  31.94 
 
 		 155 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  31.06 
 
 		 161 aa  80.9  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  31.51 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  31.51 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  32.89 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  33.1 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  32.19 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  32.48 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  30.99 
 
 		 149 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  32.68 
 
 		 150 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  36.3 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  32.93 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  28.67 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  30.09 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1490  signal transduction protein  32.89 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.421198 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  30.45 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  32 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  28.38 
 
 		 149 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  28.03 
 
 		 154 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  26.54 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  30.94 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  32.87 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  36 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  30.5 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  31.72 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  32.87 
 
 		 216 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 		 161 aa  71.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  25.66 
 
 		 152 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0825  putative signal transduction protein with CBS domains  32.14 
 
 		 148 aa  70.5  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  30.07 
 
 		 150 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  26.39 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  32.87 
 
 		 769 aa  69.7  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  34.03 
 
 		 909 aa  69.7  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  34.46 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  30.28 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  30.61 
 
 		 427 aa  68.6  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  34.69 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  29.08 
 
 		 313 aa  68.6  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  30.29 
 
 		 909 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  27.52 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  29.17 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>