135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2955 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  100 
 
 		 133 aa  261  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0431  DoxX family protein  53.54 
 
 		 136 aa  127  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4177  DoxX  55.12 
 
 		 140 aa  123  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6128  hypothetical protein  57.46 
 
 		 144 aa  123  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.134606 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  50 
 
 		 144 aa  123  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1372  DoxX family protein  52.31 
 
 		 152 aa  120  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  48.85 
 
 		 147 aa  120  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  47.37 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4059  DoxX family protein  52.27 
 
 		 131 aa  103  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4541  DoxX family protein  52.27 
 
 		 131 aa  103  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0910404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4427  DoxX family protein  51.52 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5776  DoxX family membrane protein  48.48 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  49.61 
 
 		 152 aa  97.8  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2360  DoxX family protein  48.09 
 
 		 137 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462375  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2492  DoxX family protein  47.73 
 
 		 137 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.212338  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4512  DoxX family protein  51.52 
 
 		 132 aa  96.7  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.794637 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  47.27 
 
 		 170 aa  96.3  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5142  DoxX family protein  55.81 
 
 		 132 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1834  DoxX  46.56 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2445  DoxX family protein  46.56 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2450  DoxX family protein  45.8 
 
 		 137 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0306678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1006  DoxX family protein  46.9 
 
 		 138 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0698  DoxD-like family protein  45 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.303263  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1201  hypothetical protein  45 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2315  DoxD-like family protein  45 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0132725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2972  DoxD-like family protein  45 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390379  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1040  DoxX family membrane protein  45 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1046  DoxX family protein  45 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1627  DoxD-like family protein  45 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00417873  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  40.16 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  42.28 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  32.82 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03045  DoxX subfamily  38.95 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  33.9 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  33.82 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  34.07 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  38.3 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  32.56 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  30.58 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  34.81 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  34.4 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  30.77 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  35 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  32.26 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  31.34 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  34.07 
 
 		 151 aa  52.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  33.81 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  33.33 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  35.16 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  33.33 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  31.85 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  32.06 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  36.45 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  42.05 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  30.08 
 
 		 127 aa  50.8  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  31.54 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  29.29 
 
 		 149 aa  50.4  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  32.12 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5120  DoxX family protein  37.4 
 
 		 205 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  36.29 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  34.35 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  29.7 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  33.59 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  31.15 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  33.66 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  33.06 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  37.19 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  32.33 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  38.13 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  31.93 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  32.31 
 
 		 157 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  29.5 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  38.98 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  35.61 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  35.77 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  32.56 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  32.5 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  37.19 
 
 		 174 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  35.77 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0614  DoxD-like family  29.13 
 
 		 281 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  35.48 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  29.55 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  32.06 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  32.23 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  34.4 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  31.01 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  35.77 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2401  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  34.55 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2205  DoxX  33.82 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000990864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  31.15 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  32.82 
 
 		 149 aa  43.9  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  34.06 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  28.93 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  31.82 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1539  DoxD family protein  28.35 
 
 		 281 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.636212  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3563  DoxX family protein  34.62 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1654  normal  0.902228 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  31.01 
 
 		 405 aa  43.5  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  28.35 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>