More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1682 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1682  TatD family Mg-dependent DNase  100 
 
 		 335 aa  698    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.415868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1953  TatD-related deoxyribonuclease  84.23 
 
 		 336 aa  585  1e-166  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.884488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1991  TatD-related deoxyribonuclease  56.6 
 
 		 296 aa  345  4e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.126048  decreased coverage  0.0000779322 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  38.02 
 
 		 264 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  37.6 
 
 		 259 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  31.51 
 
 		 258 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  33.44 
 
 		 256 aa  146  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  34.2 
 
 		 258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  36.02 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  35.68 
 
 		 265 aa  138  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  34.53 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  37.34 
 
 		 254 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  33.76 
 
 		 257 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  37.34 
 
 		 254 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  31.51 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  36.93 
 
 		 254 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  35.04 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  36.78 
 
 		 259 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  32.44 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  31.94 
 
 		 259 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  37.13 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  36.71 
 
 		 259 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  36.71 
 
 		 259 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  36.71 
 
 		 259 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  36.67 
 
 		 260 aa  133  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  37.08 
 
 		 260 aa  133  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  36.67 
 
 		 260 aa  132  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  32.04 
 
 		 265 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  36.4 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  37.02 
 
 		 257 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0814  TatD family hydrolase  31.51 
 
 		 258 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  35.71 
 
 		 260 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  37.02 
 
 		 257 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1137  TatD-related deoxyribonuclease  36.93 
 
 		 254 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000948863  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  36.6 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  37.02 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  36.67 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  36.6 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0791  TatD family deoxyribonuclease  31.19 
 
 		 258 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2825  TatD-related deoxyribonuclease  35.27 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000784183  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  33.61 
 
 		 256 aa  127  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1022  TatD-related deoxyribonuclease  35.21 
 
 		 255 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454975  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  32.78 
 
 		 262 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  34.58 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0952  hydrolase, TatD family  31.18 
 
 		 232 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  31.83 
 
 		 293 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3243  TatD-related deoxyribonuclease  32.17 
 
 		 282 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  33.01 
 
 		 284 aa  123  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  32.62 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  33.61 
 
 		 255 aa  122  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  33.61 
 
 		 255 aa  122  8e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3462  TatD-related deoxyribonuclease  37.13 
 
 		 278 aa  122  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  34.31 
 
 		 263 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  33.48 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3552  TatD-related deoxyribonuclease  34.17 
 
 		 263 aa  119  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158223  decreased coverage  0.000000675028 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  35.42 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  31.78 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1444  TatD-related deoxyribonuclease  34.17 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5965  TatD-related deoxyribonuclease  35.83 
 
 		 262 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2130  TatD-related deoxyribonuclease  35.83 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924229  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2112  TatD-related deoxyribonuclease  35.83 
 
 		 262 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363991  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  32.77 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3885  TatD-related deoxyribonuclease  32.5 
 
 		 287 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18210  TatD family deoxyribonuclease  39.88 
 
 		 225 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3381  TatD-related deoxyribonuclease  32.08 
 
 		 278 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000756036  hitchhiker  0.00541982 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1158  TatD-related deoxyribonuclease  34.17 
 
 		 262 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227314  hitchhiker  0.00871913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1078  TatD-related deoxyribonuclease  31.01 
 
 		 277 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.013378  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001920  deoxyribonuclease TatD  32.22 
 
 		 253 aa  116  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1889  TatD family hydrolase  34.58 
 
 		 262 aa  116  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4583  TatD-related deoxyribonuclease  32.37 
 
 		 273 aa  116  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1466  TatD-related deoxyribonuclease  28.88 
 
 		 278 aa  115  7.999999999999999e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0488  putative TatD related DNase  35.02 
 
 		 256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  29.49 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  31.8 
 
 		 464 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3416  TatD-related deoxyribonuclease  31.31 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00399053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  34.58 
 
 		 262 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0491  TatD-related deoxyribonuclease  32.64 
 
 		 244 aa  114  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  31.91 
 
 		 260 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0133  TatD-related deoxyribonuclease  34.33 
 
 		 260 aa  113  5e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0239  TatD family deoxyribonuclease  30.71 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  34.6 
 
 		 253 aa  112  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  31.8 
 
 		 256 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  30.35 
 
 		 270 aa  112  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0800  TatD family hydrolase  33.19 
 
 		 274 aa  112  9e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2149  TatD-related deoxyribonuclease  35 
 
 		 262 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193647  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2750  TatD-related deoxyribonuclease  31.25 
 
 		 279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2415  hypothetical protein  31.8 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000025534  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03379  hypothetical protein  31.51 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3003  TatD related DNase  32.08 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0100671  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  27.8 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00569  deoxyribonuclease  31.09 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1568  putative TatD-related deoxyribonuclease  34.73 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.227212 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  31.38 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3500  TatD family hydrolase  35.17 
 
 		 262 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0833  TatD family hydrolase  35.17 
 
 		 269 aa  110  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3629  TatD-related deoxyribonuclease  35.17 
 
 		 269 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.978125  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  29.66 
 
 		 255 aa  109  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  31.36 
 
 		 256 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  29.83 
 
 		 462 aa  109  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  29.71 
 
 		 270 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.446908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>