233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0891 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0891  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  465  9.999999999999999e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.735718  normal  0.888939 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1531  TetR family transcriptional regulator  98.68 
 
 		 227 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.357864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1913  TetR family transcriptional regulator  78.38 
 
 		 226 aa  355  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000580043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2204  putative transcriptional regulator  29.89 
 
 		 212 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 212 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 206 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 219 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  29.89 
 
 		 220 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 211 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1609  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 205 aa  52.4  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3699  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158617  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 203 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1681  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.977422 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 202 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  29.95 
 
 		 204 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 203 aa  48.5  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3329  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000330103  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 204 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003710  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.485423  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1460  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6854  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.101929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0237  transcriptional regulator  28.97 
 
 		 175 aa  46.2  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000134845  hitchhiker  0.00000000249443 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5796  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0048122 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  30.77 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0185  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141931  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0620  nucleoid occlusion protein  37.66 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000140669 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6699  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.678516  normal  0.427356 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2512  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290305  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1818  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671958  normal  0.199135 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 141 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 211 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  36.07 
 
 		 204 aa  45.8  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  40.74 
 
 		 251 aa  45.4  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  37.66 
 
 		 224 aa  45.8  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 201 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 236 aa  45.4  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 194 aa  45.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 208 aa  45.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 228 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 222 aa  45.4  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1789  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 210 aa  45.4  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484582  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>