More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0690 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0690  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  559  1e-158  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000105765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0661  peptidase M23B  91.91 
 
 		 270 aa  512  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0851983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1756  peptidase M23B  61.07 
 
 		 272 aa  306  3e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657093  decreased coverage  0.0000000551494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  34.81 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  35.93 
 
 		 293 aa  148  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  39.35 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  35.95 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  30.53 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  36 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  36.23 
 
 		 262 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1252  lipoprotein NlpD  36.48 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18696  normal  0.0631891 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  36.48 
 
 		 301 aa  139  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  35.43 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  34.49 
 
 		 295 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  33.08 
 
 		 265 aa  138  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  32.53 
 
 		 297 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  34.15 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  34.67 
 
 		 256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5969  Peptidase M23  33.09 
 
 		 261 aa  135  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  37.44 
 
 		 272 aa  135  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  30.38 
 
 		 264 aa  135  8e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  32.38 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  33.71 
 
 		 270 aa  135  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  39.32 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  33.56 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  36.1 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  32.24 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  33.09 
 
 		 292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  31.38 
 
 		 285 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  32.73 
 
 		 288 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  29.96 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  35.44 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  35.44 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  36.24 
 
 		 298 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  37.67 
 
 		 230 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  36.24 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  36.24 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  37.27 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  36.24 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  36.24 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  36.24 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  36.24 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1246  novel lipoprotein homolog NlpD  33.74 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  30.42 
 
 		 309 aa  125  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  29.79 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  34.06 
 
 		 290 aa  125  7e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1246  novel lipoprotein homolog NlpD  33.74 
 
 		 247 aa  125  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  31.62 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  34.27 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  34.8 
 
 		 328 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0061  lipoprotein NlpD  32.58 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  36.24 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  32.81 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2750  peptidase M23B  29.15 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  36.74 
 
 		 230 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  35.85 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  35.85 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  35.85 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  43.66 
 
 		 307 aa  122  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  35.85 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1694  putative lipoprotein nlpD  31.7 
 
 		 329 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.807801 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  35.85 
 
 		 251 aa  122  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  32.58 
 
 		 323 aa  122  8e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  35.98 
 
 		 296 aa  121  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  37.83 
 
 		 292 aa  122  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  34.09 
 
 		 292 aa  121  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  35.98 
 
 		 296 aa  121  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  35.51 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  35.51 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1123  peptidase M23B  32.39 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  35.51 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  35.51 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  34.01 
 
 		 318 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  37.27 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  32.37 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  30.48 
 
 		 360 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  35.85 
 
 		 250 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1078  putative lipoprotein NlpD  31.6 
 
 		 283 aa  119  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  35.19 
 
 		 307 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  31.78 
 
 		 315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3433  lipoprotein NlpD  30.74 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  30 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  36.24 
 
 		 236 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  33.64 
 
 		 236 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  36.32 
 
 		 251 aa  119  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  31.65 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  35.38 
 
 		 250 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  35.38 
 
 		 250 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  35.38 
 
 		 250 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  32.31 
 
 		 261 aa  119  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  35.38 
 
 		 250 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1122  peptidase M23B  30.08 
 
 		 298 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1193  peptidase M23B  30.08 
 
 		 298 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.8562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  35.07 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3120  peptidase M23B  29.37 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  32.55 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3272  peptidase M23B  29.12 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  35.24 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  35.85 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  35.85 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0947828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>