153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0314 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  100 
 
 
242 aa  500  1e-141  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  96.69 
 
 
242 aa  489  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  71.67 
 
 
245 aa  374  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.63 
 
 
252 aa  99.8  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  32.79 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  30 
 
 
279 aa  87  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  28.28 
 
 
251 aa  85.9  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  31.09 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  29.22 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  30.4 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  29.43 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  35.9 
 
 
248 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.69 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  29.32 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  31.08 
 
 
249 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  37.66 
 
 
249 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  30.12 
 
 
255 aa  78.6  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  28.63 
 
 
254 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.27 
 
 
249 aa  77  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  28.79 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  28.79 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3997  Baf family transcriptional activator  29.48 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000868707  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  35.9 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  26.56 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  35.9 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  28.06 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  35.9 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  27.54 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  28.4 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  27.6 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  35.9 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  35.9 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  26.79 
 
 
293 aa  72  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  27.5 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  26.53 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  27.52 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  36.18 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  27.44 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  27.13 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  27 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  26.42 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  27.41 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  25.2 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  28.44 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  30 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.75 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  27.56 
 
 
256 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  30.72 
 
 
254 aa  63.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  26.82 
 
 
252 aa  64.3  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  26.19 
 
 
284 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1376  putative transcriptional acitvator, Baf family  23.63 
 
 
252 aa  60.5  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0638474  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  25.93 
 
 
243 aa  59.7  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0238  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.32 
 
 
260 aa  59.7  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  28.23 
 
 
242 aa  59.7  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0974  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.38 
 
 
242 aa  59.7  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158995  normal  0.397357 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0383  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.72 
 
 
257 aa  59.3  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0273469  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5203  pantothenate kinase  26.99 
 
 
240 aa  58.9  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  26.88 
 
 
244 aa  58.5  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2715  putative transcriptional activator, Baf family  25.38 
 
 
255 aa  58.5  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3221  pantothenate kinase  27.1 
 
 
272 aa  58.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  25.84 
 
 
277 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  29.27 
 
 
253 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0044  pantothenate kinase  23.97 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0044  pantothenate kinase  23.29 
 
 
251 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.504635  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  29.08 
 
 
243 aa  56.6  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  29.63 
 
 
258 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  27.17 
 
 
254 aa  55.8  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  27.39 
 
 
251 aa  55.1  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0777  pantothenate kinase  23.39 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  34.17 
 
 
221 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  27.45 
 
 
256 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  27.45 
 
 
256 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  27.45 
 
 
256 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  27.45 
 
 
256 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  27.45 
 
 
256 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0188  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.23 
 
 
223 aa  54.3  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164212  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0625  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.14 
 
 
263 aa  54.3  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1297  putative transcriptional acitvator, Baf family  22.9 
 
 
268 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  26.56 
 
 
244 aa  53.1  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1367  pantothenate kinase  28.57 
 
 
247 aa  53.1  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  23.9 
 
 
255 aa  52.8  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  27.06 
 
 
256 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  25.56 
 
 
275 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1093  putative transcriptional activator, Baf family  27.54 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.040353  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1724  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.29 
 
 
266 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.345789  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0109  Baf family transcriptional regulator  28.1 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00933818  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1150  pantothenate kinase  25 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0493406  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2229  pantothenate kinase  26.67 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00901  transcriptional regulator  28.29 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66751  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0452  pantothenate kinase  25.88 
 
 
275 aa  50.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  26.39 
 
 
289 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4170  pantothenate kinase  27.04 
 
 
241 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3000  pantothenate kinase  27.44 
 
 
260 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1638  pantothenate kinase  27.34 
 
 
206 aa  50.1  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.66 
 
 
254 aa  49.7  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.14 
 
 
254 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0481  pantothenate kinase  27.34 
 
 
207 aa  49.3  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  27.4 
 
 
274 aa  49.3  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  31.82 
 
 
254 aa  48.9  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0452  transcriptional activator, putative, Baf family  30.89 
 
 
241 aa  48.5  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>