75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0481 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0481  pantothenate kinase  100 
 
 		 207 aa  421  1e-117  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0443  pantothenate kinase  71.57 
 
 		 209 aa  312  1.9999999999999998e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0676468  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0417  pantothenate kinase  71.57 
 
 		 209 aa  311  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000353055  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1564  pantothenate kinase  71.08 
 
 		 209 aa  309  2e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0585  transcriptional activator, Baf family  54.68 
 
 		 207 aa  247  8e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0993  pantothenate kinase  57.21 
 
 		 209 aa  246  1e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1150  pantothenate kinase  54.9 
 
 		 210 aa  239  2e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0493406  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0217  pantothenate kinase  54.68 
 
 		 209 aa  236  2e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1638  pantothenate kinase  53.54 
 
 		 206 aa  219  1.9999999999999999e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0888  pantothenate kinase  42.21 
 
 		 205 aa  155  4e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.394748  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  33.59 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  31.15 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0188  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.57 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164212  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  26 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  26 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1218  pantothenate kinase  24.5 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0258135  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  29.8 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  28.49 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  29.14 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  28.76 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  29.66 
 
 		 279 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  27.39 
 
 		 249 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  27.33 
 
 		 249 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1367  pantothenate kinase  24.69 
 
 		 247 aa  52.4  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  28 
 
 		 248 aa  52  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  27.39 
 
 		 249 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.35 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  26.14 
 
 		 248 aa  50.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0958  pantothenate kinase  25 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0835  pantothenate kinase  24.9 
 
 		 268 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  27.27 
 
 		 249 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  29.17 
 
 		 243 aa  50.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  27.54 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0613  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.25 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0452  transcriptional activator, putative, Baf family  26.25 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  26.67 
 
 		 245 aa  49.7  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  35.71 
 
 		 254 aa  49.7  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  27.34 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1765  pantothenate kinase  24.21 
 
 		 272 aa  49.3  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  23.95 
 
 		 269 aa  48.9  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  29.13 
 
 		 249 aa  48.9  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  26.67 
 
 		 247 aa  48.1  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2997  pantothenate kinase  26.13 
 
 		 258 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4170  pantothenate kinase  28.3 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  27.34 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  31.13 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0044  pantothenate kinase  26.62 
 
 		 251 aa  47  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.504635  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  28.03 
 
 		 249 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3123  pantothenate kinase  26.13 
 
 		 258 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  25.48 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3950  transcriptional activator, Baf family  31.08 
 
 		 275 aa  46.6  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.151216  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0044  pantothenate kinase  25.71 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00921  transcriptional regulator  32.23 
 
 		 231 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  22.71 
 
 		 266 aa  45.8  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1772  pantothenate kinase  26.7 
 
 		 255 aa  45.8  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  24.84 
 
 		 256 aa  45.1  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  34.12 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2217  pantothenate kinase  23.49 
 
 		 263 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2715  putative transcriptional activator, Baf family  29.69 
 
 		 255 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  24.84 
 
 		 249 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1376  putative transcriptional acitvator, Baf family  23.26 
 
 		 252 aa  44.3  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0638474  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0083  putative transcriptional acitvator, Baf  27.03 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3997  Baf family transcriptional activator  27.92 
 
 		 246 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000868707  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00891  transcriptional regulator  22.76 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.529002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  28.09 
 
 		 266 aa  42.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  29.66 
 
 		 244 aa  42.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1444  accessory factor Bvg  26.47 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.327883  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1408  pantothenate kinase  25.16 
 
 		 270 aa  42  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.46 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1811  pantothenate kinase  29.69 
 
 		 262 aa  42  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01451  transcriptional regulator  24.24 
 
 		 247 aa  42  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  30.37 
 
 		 244 aa  41.6  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0777  pantothenate kinase  33.33 
 
 		 254 aa  41.6  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0238  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.15 
 
 		 260 aa  41.2  0.01  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  24.15 
 
 		 255 aa  41.2  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>