73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0585 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0585  transcriptional activator, Baf family  100 
 
 
207 aa  427  1e-119  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0993  pantothenate kinase  60.1 
 
 
209 aa  264  8e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0217  pantothenate kinase  59.11 
 
 
209 aa  261  6.999999999999999e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0443  pantothenate kinase  59.11 
 
 
209 aa  258  3e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0676468  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0417  pantothenate kinase  59.11 
 
 
209 aa  258  4e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000353055  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1564  pantothenate kinase  58.62 
 
 
209 aa  256  2e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0481  pantothenate kinase  54.68 
 
 
207 aa  247  8e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1150  pantothenate kinase  54.68 
 
 
210 aa  239  2e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0493406  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1638  pantothenate kinase  49.76 
 
 
206 aa  224  9e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0888  pantothenate kinase  39.32 
 
 
205 aa  159  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.394748  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0452  transcriptional activator, putative, Baf family  30.34 
 
 
241 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0613  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.34 
 
 
241 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0188  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.56 
 
 
223 aa  58.5  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164212  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  32.76 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  30.46 
 
 
249 aa  57  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  24.76 
 
 
248 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  27.85 
 
 
243 aa  56.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0044  pantothenate kinase  25.73 
 
 
251 aa  54.7  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.504635  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0044  pantothenate kinase  25.31 
 
 
246 aa  55.1  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1367  pantothenate kinase  29.86 
 
 
247 aa  54.7  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  28.66 
 
 
247 aa  53.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  29.51 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  27.89 
 
 
249 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1218  pantothenate kinase  28.57 
 
 
266 aa  53.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0258135  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  26.28 
 
 
256 aa  51.6  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  28.57 
 
 
270 aa  52  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0083  putative transcriptional acitvator, Baf  27.33 
 
 
227 aa  51.2  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.08 
 
 
252 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  28.86 
 
 
248 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  27.89 
 
 
249 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  28.95 
 
 
251 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00921  transcriptional regulator  28.82 
 
 
231 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  27.52 
 
 
244 aa  49.7  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  25.57 
 
 
254 aa  49.7  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  29.8 
 
 
252 aa  49.3  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  25.42 
 
 
245 aa  49.3  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3123  pantothenate kinase  27.33 
 
 
258 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.47 
 
 
269 aa  48.5  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  30.3 
 
 
246 aa  48.5  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.11 
 
 
249 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2997  pantothenate kinase  27.33 
 
 
258 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1164  Baf family transcriptional activator  28.4 
 
 
270 aa  47.8  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  29.03 
 
 
244 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  27.7 
 
 
251 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  28.8 
 
 
279 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4170  pantothenate kinase  27.5 
 
 
241 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  24.54 
 
 
255 aa  46.2  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  24.82 
 
 
242 aa  45.4  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  24.03 
 
 
255 aa  45.1  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  22.39 
 
 
253 aa  45.1  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  26.77 
 
 
266 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00931  transcriptional regulator  25.88 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  25 
 
 
249 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  24.11 
 
 
242 aa  44.3  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  22.79 
 
 
258 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  37.8 
 
 
254 aa  43.5  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.98 
 
 
255 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  22.79 
 
 
258 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  27.52 
 
 
249 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  22.97 
 
 
254 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  46.94 
 
 
266 aa  43.5  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  27.89 
 
 
249 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  34.88 
 
 
248 aa  43.1  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0958  pantothenate kinase  26.53 
 
 
260 aa  42.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  25 
 
 
249 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1772  pantothenate kinase  25.9 
 
 
255 aa  42.4  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  24.88 
 
 
255 aa  42.4  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  24.31 
 
 
284 aa  42.4  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  30.3 
 
 
256 aa  42  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  25.17 
 
 
249 aa  42  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  22.07 
 
 
262 aa  41.6  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  23.53 
 
 
256 aa  41.6  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  26.8 
 
 
260 aa  41.2  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>