38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0888 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0888  pantothenate kinase  100 
 
 		 205 aa  417  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.394748  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0585  transcriptional activator, Baf family  39.32 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0993  pantothenate kinase  37.93 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0481  pantothenate kinase  42.21 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0417  pantothenate kinase  41.87 
 
 		 209 aa  154  7e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000353055  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1564  pantothenate kinase  41.38 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0443  pantothenate kinase  41.38 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0676468  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1150  pantothenate kinase  39.9 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0493406  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1638  pantothenate kinase  40.19 
 
 		 206 aa  140  9e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0217  pantothenate kinase  34.83 
 
 		 209 aa  138  4.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0188  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.2 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164212  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  31.01 
 
 		 242 aa  62  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  26.45 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1093  putative transcriptional activator, Baf family  32.87 
 
 		 248 aa  54.7  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.040353  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3123  pantothenate kinase  25 
 
 		 258 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  26.35 
 
 		 249 aa  52.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2997  pantothenate kinase  24.55 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00891  transcriptional regulator  23.28 
 
 		 228 aa  48.5  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.529002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  31.62 
 
 		 244 aa  48.9  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  27.7 
 
 		 251 aa  48.1  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  32.38 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  25 
 
 		 251 aa  46.2  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  25 
 
 		 254 aa  45.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3950  transcriptional activator, Baf family  25.42 
 
 		 275 aa  45.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.151216  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  30.4 
 
 		 279 aa  45.1  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0613  putative transcriptional acitvator, Baf family  24.59 
 
 		 241 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0452  transcriptional activator, putative, Baf family  24.59 
 
 		 241 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4022  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.72 
 
 		 264 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147612 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  31.62 
 
 		 244 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5203  pantothenate kinase  27.66 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  26.53 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0044  pantothenate kinase  23.05 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1772  pantothenate kinase  34.78 
 
 		 255 aa  43.5  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  27.72 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0044  pantothenate kinase  27.34 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.504635  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1265  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.67 
 
 		 262 aa  42.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  30.46 
 
 		 258 aa  42.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1724  putative transcriptional acitvator, Baf family  24.48 
 
 		 266 aa  42  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.345789  normal  0.471645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>