More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1079 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1079  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  423  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435292 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0257  LysR family transcriptional regulator  53.89 
 
 		 299 aa  235  4e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1423  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  53.09 
 
 		 311 aa  226  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001225  transcriptional regulator LysR family  51.81 
 
 		 299 aa  224  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338504  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3853  LysR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 306 aa  216  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1689  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  48.44 
 
 		 300 aa  205  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3712  LysR family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 304 aa  199  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4691  LysR family substrate binding transcriptional regulator  45.36 
 
 		 300 aa  194  7e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000050  transcriptional regulator LysR family  47.42 
 
 		 300 aa  183  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.385466  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 298 aa  180  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 295 aa  178  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 298 aa  177  8e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 296 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 298 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  44.97 
 
 		 335 aa  169  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1733  transcriptional regulator, LysR family  45.36 
 
 		 301 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368943  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2436  LysR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 337 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399633  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2214  LysR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 300 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000844726  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  42.41 
 
 		 289 aa  166  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 299 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1660  transcriptional regulator, LysR family  46.28 
 
 		 301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0094894  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2734  LysR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 306 aa  165  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 307 aa  165  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  43.55 
 
 		 299 aa  165  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 313 aa  165  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 298 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 304 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  42.33 
 
 		 298 aa  164  8e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1221  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 309 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678817  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.58 
 
 		 299 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 303 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3029  LysR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 304 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686925 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 298 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1678  transcriptional regulator, LysR family  43.08 
 
 		 305 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 292 aa  162  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3528  transcriptional regulator, LysR family  40.31 
 
 		 299 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4604  transcriptional regulator, LysR family  40.31 
 
 		 299 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23540  putative transcriptional regulator  40.74 
 
 		 306 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483794 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  39.71 
 
 		 302 aa  161  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  40.62 
 
 		 305 aa  161  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3189  LysR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 302 aa  161  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.77747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5031  LysR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 302 aa  161  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 322 aa  161  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 305 aa  161  7e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  39.27 
 
 		 289 aa  161  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1993  putative transcriptional regulator  40.74 
 
 		 306 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1765  transcriptional regulator, LysR family  41.24 
 
 		 298 aa  161  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.389128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0459  transcriptional regulator, LysR family  42.02 
 
 		 297 aa  160  9e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0542  transcription regulator protein  46.07 
 
 		 305 aa  160  9e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164617  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4882  LysR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 297 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6129  LysR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 305 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2632  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 291 aa  160  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5388  LysR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 297 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 297 aa  159  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2957  transcriptional regulator, LysR family  39.58 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014906 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  39.27 
 
 		 289 aa  159  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5474  LysR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 297 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  39.58 
 
 		 293 aa  159  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3311  LysR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 294 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 306 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3610  hypothetical protein  42.78 
 
 		 299 aa  158  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  39.71 
 
 		 298 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  41.62 
 
 		 306 aa  158  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  39.58 
 
 		 301 aa  158  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 295 aa  158  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  41.62 
 
 		 305 aa  158  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 303 aa  158  5e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4060  transcriptional regulator, LysR family protein  38.74 
 
 		 288 aa  158  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.833958  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2250  LysR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 302 aa  158  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  38.83 
 
 		 295 aa  158  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0883  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 294 aa  158  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.427217  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 305 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0638  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 294 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0086  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 294 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0880  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 294 aa  157  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.803519  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0339  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 294 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1042  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 294 aa  158  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 305 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1509  putative transcriptional regulator  39.79 
 
 		 302 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 305 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2473  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 294 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00812964  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3137  LysR family transcriptional regulator  42.63 
 
 		 298 aa  157  9e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0121  LysR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 296 aa  157  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92229  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0131  LysR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 294 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 307 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  41.62 
 
 		 309 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 294 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 304 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2132  transcriptional regulator, LysR family  39.18 
 
 		 298 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  40.53 
 
 		 298 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1061  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 301 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1994  LysR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 305 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 298 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2924  LysR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 294 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.842726  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3226  LysR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 309 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 297 aa  156  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1557  transcriptional regulator, LysR family  41.21 
 
 		 298 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 316 aa  156  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17380  LysR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 302 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650762  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>