More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4661 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4785  Sel1 domain protein repeat-containing protein  99.45 
 
 		 181 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0833699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4661  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 181 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.150722  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4839  Sel1 domain-containing protein  98.34 
 
 		 181 aa  362  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0635  Sel1 domain-containing protein  89.5 
 
 		 181 aa  300  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00101027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4343  Sel1 repeat-containing protein  72.68 
 
 		 182 aa  270  9e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12370  hypothetical protein  71.58 
 
 		 182 aa  257  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4948  Sel1 repeat-containing protein  73.37 
 
 		 184 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4802  hypothetical protein  72.13 
 
 		 182 aa  249  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09250  tetratricopeptide TPR-like helical protein  66.29 
 
 		 181 aa  235  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3776  Sel1 domain-containing protein  66.12 
 
 		 182 aa  225  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.17848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1130  hypothetical protein  71.04 
 
 		 182 aa  225  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  44.05 
 
 		 2413 aa  70.9  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  37.3 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  35.94 
 
 		 789 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2074  Sel1 repeat-containing protein  32.17 
 
 		 295 aa  67  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000314497  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  31.9 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  32.76 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  40.45 
 
 		 552 aa  65.1  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  32.26 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  35.51 
 
 		 393 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  48.75 
 
 		 490 aa  65.1  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  48.75 
 
 		 490 aa  64.7  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  43.04 
 
 		 961 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  35.94 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.33 
 
 		 997 aa  61.2  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  35.79 
 
 		 303 aa  61.2  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  36.67 
 
 		 425 aa  60.8  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  34.21 
 
 		 294 aa  60.8  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.21 
 
 		 294 aa  60.8  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.41 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  39.33 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  37.84 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0462  Sel1 domain-containing protein  39.56 
 
 		 511 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.781261  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  40.48 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  35.29 
 
 		 373 aa  58.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  40 
 
 		 684 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  38.71 
 
 		 1475 aa  58.9  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  35.29 
 
 		 373 aa  58.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0483  Sel1 domain-containing protein  38.46 
 
 		 511 aa  58.2  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0431486  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  29.37 
 
 		 245 aa  58.2  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  33.61 
 
 		 1402 aa  57.8  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  36.56 
 
 		 817 aa  57.8  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  37.63 
 
 		 1281 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  37.36 
 
 		 1877 aa  57  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 		 448 aa  57  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  31.43 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  36.84 
 
 		 328 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0326  Sel1 domain-containing protein  28.95 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452789  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  30.19 
 
 		 731 aa  57  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  41.67 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3857  Sel1 domain-containing protein  37.36 
 
 		 511 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.277473  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  38.3 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  36.89 
 
 		 489 aa  56.6  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.93 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0486  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.46 
 
 		 511 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 557 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  27.75 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.48 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  38.3 
 
 		 438 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.89 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  35.87 
 
 		 722 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  35.87 
 
 		 722 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1107  hypothetical protein  37.8 
 
 		 935 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.489454 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  39.19 
 
 		 647 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  35.87 
 
 		 722 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  35.53 
 
 		 850 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  35.87 
 
 		 722 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  31.47 
 
 		 509 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3360  serine/threonine protein kinase  40.5 
 
 		 656 aa  55.1  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0976665 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  36.56 
 
 		 831 aa  55.1  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.45 
 
 		 341 aa  54.7  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.51 
 
 		 565 aa  54.3  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  33.61 
 
 		 256 aa  54.3  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  34.04 
 
 		 264 aa  54.3  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  31.47 
 
 		 509 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0453  hypothetical protein  28.12 
 
 		 329 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.98 
 
 		 1110 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3510  Sel1 domain-containing protein  34.02 
 
 		 512 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.765295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  41.56 
 
 		 193 aa  53.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  35.56 
 
 		 267 aa  53.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  33.9 
 
 		 509 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.78 
 
 		 865 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  34.38 
 
 		 765 aa  53.5  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  33.9 
 
 		 509 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  34.34 
 
 		 380 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  30.89 
 
 		 1134 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.78 
 
 		 318 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.8 
 
 		 1344 aa  53.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  35.11 
 
 		 1037 aa  53.5  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.77 
 
 		 1226 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  34.29 
 
 		 304 aa  53.1  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  38.38 
 
 		 380 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3685  Sel1 domain-containing protein  32.29 
 
 		 512 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0024  putative signal peptide protein  33.94 
 
 		 252 aa  52.4  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0407866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1424  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37 
 
 		 357 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240665  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  31.97 
 
 		 971 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2980  Sel1 domain-containing protein  29.41 
 
 		 254 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0442  Sel1 domain-containing protein  32.99 
 
 		 512 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.375518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  32.74 
 
 		 1493 aa  52.4  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>