More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2793 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2516  type II secretion system protein  86.87 
 
 		 396 aa  637    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2793  type II secretion system protein  100 
 
 		 396 aa  776    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3424  type II secretion system protein  85.86 
 
 		 403 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2338  type II secretion system protein  85.86 
 
 		 396 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1972  type II secretion system protein  66.92 
 
 		 395 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28630  Type II secretion system protein F  62.72 
 
 		 396 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1433  type II secretion system protein F  49.87 
 
 		 392 aa  345  8.999999999999999e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2420  type II secretion system protein  46.73 
 
 		 393 aa  330  3e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1342  type II secretion system protein  46.97 
 
 		 395 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1294  type II secretion system protein F  48.7 
 
 		 389 aa  322  6e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0082723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3879  type II secretion system protein  46.21 
 
 		 397 aa  321  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2589  type II secretion system protein  47.22 
 
 		 394 aa  318  1e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02971  general secretion pathway GSPF-like transmembrane protein  42.61 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3222  type II secretion system protein  42.42 
 
 		 394 aa  245  9e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.333811 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1432  type II secretion system protein  38.32 
 
 		 393 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4712  Type II secretory pathway, gspf-related transmembrane protein  37.11 
 
 		 413 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.992517  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2309  putative GSPF-related transmembrane protein  37.13 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.281801  normal  0.163088 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1923  type II secretion system protein  31.94 
 
 		 402 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.919085  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1784  type IV pilus biogenesis protein PilC, putative  33.42 
 
 		 402 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1865  type II secretion system protein  34.24 
 
 		 402 aa  210  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1278  type II secretion system protein  36.27 
 
 		 401 aa  209  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1685  type II secretory pathway, component PulF  32.31 
 
 		 402 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381238  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1450  type II secretion system protein  34.94 
 
 		 405 aa  200  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2613  type II secretion system protein  37.6 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.95954 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  32.66 
 
 		 402 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  30.27 
 
 		 407 aa  194  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  28.28 
 
 		 406 aa  192  6e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  29.28 
 
 		 408 aa  192  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  27.92 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  30.35 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.66 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  29.33 
 
 		 403 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  28.04 
 
 		 419 aa  187  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  27.5 
 
 		 405 aa  187  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  28.84 
 
 		 408 aa  186  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  33 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  33 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  29.57 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3005  type II secretion system protein  35.14 
 
 		 401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00232151 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  32.03 
 
 		 403 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1317  type II secretory pathway protein LspF  29.85 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  27.22 
 
 		 407 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1575  type II secretion system protein  31.36 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377421  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2922  general secretion pathway protein F  29.57 
 
 		 405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  33.76 
 
 		 405 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  27.43 
 
 		 406 aa  180  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  31.59 
 
 		 405 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  33.5 
 
 		 405 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  33.5 
 
 		 405 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  33.5 
 
 		 405 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  33.5 
 
 		 405 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  33.76 
 
 		 405 aa  179  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  33.5 
 
 		 405 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  33.5 
 
 		 405 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1314  type II secretory pathway protein LspF  29.34 
 
 		 399 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  27.05 
 
 		 404 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  32.29 
 
 		 405 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  28.31 
 
 		 463 aa  178  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  28.31 
 
 		 463 aa  178  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  26.8 
 
 		 406 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  31.11 
 
 		 409 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  27.27 
 
 		 423 aa  177  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  32.92 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  27.02 
 
 		 401 aa  177  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  26.46 
 
 		 419 aa  177  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  29.31 
 
 		 417 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  27.55 
 
 		 422 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  26.85 
 
 		 406 aa  177  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2185  Type II secretion system F domain protein  30.15 
 
 		 403 aa  177  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.170941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  27.85 
 
 		 420 aa  176  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  33.76 
 
 		 405 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0010  general secretion pathway protein F  33.76 
 
 		 405 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  33.76 
 
 		 405 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  27.3 
 
 		 419 aa  176  9e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  29.91 
 
 		 422 aa  175  9.999999999999999e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  27.73 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0130  type II secretory pathway, component PulF  32.3 
 
 		 401 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  33.5 
 
 		 405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0060  general secretion pathway protein F  33.5 
 
 		 405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0050  general secretion pathway protein F  33.5 
 
 		 405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899692  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  30.62 
 
 		 407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  30.43 
 
 		 417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  28.46 
 
 		 403 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  27.42 
 
 		 409 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  27.17 
 
 		 405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  29.86 
 
 		 405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  28.49 
 
 		 403 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0150  type II secretion system protein  30.37 
 
 		 410 aa  172  6.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  29.56 
 
 		 409 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  28.72 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02677  general secretion pathway protein F  31.32 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0547  type II secretion system protein  32.26 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0476697 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3401  general secretion pathway protein F  34.29 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.54461 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  25.74 
 
 		 405 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  30.23 
 
 		 417 aa  171  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  26.81 
 
 		 405 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3054  general secretion pathway protein F  34.27 
 
 		 403 aa  170  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2182  general secretion pathway protein F  32.33 
 
 		 399 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  33.33 
 
 		 406 aa  170  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>