288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3426 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  64.63 
 
 
527 aa  695    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  69.43 
 
 
530 aa  766    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  65.14 
 
 
527 aa  699    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  65.52 
 
 
525 aa  719    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  62.66 
 
 
522 aa  657    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  62.12 
 
 
523 aa  662    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  100 
 
 
528 aa  1069    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  41.7 
 
 
519 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  46.39 
 
 
537 aa  334  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  39.51 
 
 
539 aa  333  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  44.06 
 
 
538 aa  326  6e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  43.95 
 
 
539 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  35.94 
 
 
504 aa  298  1e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  42.02 
 
 
547 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  34.5 
 
 
552 aa  293  4e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  35.35 
 
 
551 aa  288  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  34.46 
 
 
540 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  38.39 
 
 
552 aa  280  4e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  32.82 
 
 
552 aa  280  5e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  33.99 
 
 
541 aa  280  6e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  34.44 
 
 
576 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  39.85 
 
 
533 aa  278  3e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  33.03 
 
 
568 aa  276  6e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  32.52 
 
 
600 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  35 
 
 
552 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  31.2 
 
 
587 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  35 
 
 
552 aa  269  7e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  35 
 
 
552 aa  269  7e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  30.76 
 
 
587 aa  269  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  35 
 
 
552 aa  269  7e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  35 
 
 
552 aa  269  8e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  32.03 
 
 
603 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  34.65 
 
 
552 aa  269  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  34.07 
 
 
569 aa  268  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  33.27 
 
 
587 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  30.83 
 
 
587 aa  266  8e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  35.45 
 
 
595 aa  265  1e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  31.95 
 
 
593 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  35.36 
 
 
560 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  34.31 
 
 
548 aa  264  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  33.83 
 
 
563 aa  264  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  34.17 
 
 
588 aa  264  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  36.97 
 
 
539 aa  263  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  33.83 
 
 
594 aa  263  4e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  39.4 
 
 
525 aa  263  8e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  35.59 
 
 
567 aa  262  8.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  31.5 
 
 
587 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  31.5 
 
 
587 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  38 
 
 
538 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  31.5 
 
 
587 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  32.12 
 
 
565 aa  261  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  32.47 
 
 
570 aa  260  5.0000000000000005e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  32.47 
 
 
570 aa  260  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  34.51 
 
 
566 aa  259  6e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  31.7 
 
 
677 aa  259  8e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4573  flagellar MS-ring protein  32.91 
 
 
538 aa  259  9e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.628076  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  38.63 
 
 
562 aa  259  9e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  32.47 
 
 
570 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  33.74 
 
 
551 aa  259  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  31.76 
 
 
598 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  31.76 
 
 
598 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  32.6 
 
 
569 aa  258  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  31.81 
 
 
598 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0688  flagellar MS-ring protein  33.27 
 
 
512 aa  257  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  34.13 
 
 
532 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  35.81 
 
 
571 aa  256  7e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  32.47 
 
 
568 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1337  flagellar M-ring protein FliF  33.69 
 
 
524 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.435471  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  35.25 
 
 
590 aa  255  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  33.2 
 
 
592 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  31.57 
 
 
598 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  31.57 
 
 
598 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  31.57 
 
 
598 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  31.57 
 
 
598 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  32.3 
 
 
576 aa  253  5.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  32.4 
 
 
579 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  38.35 
 
 
580 aa  253  6e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  32.4 
 
 
579 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  32.4 
 
 
576 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  32.4 
 
 
579 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  35.59 
 
 
611 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  35.59 
 
 
611 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  32.21 
 
 
579 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1880  flagellar MS-ring protein  33.27 
 
 
548 aa  250  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364366  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0472  flagellar MS-ring protein  35.08 
 
 
566 aa  250  5e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  32.55 
 
 
567 aa  249  6e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  30.18 
 
 
544 aa  249  9e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  31.49 
 
 
592 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  30.46 
 
 
544 aa  249  1e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0218  flagellar M-ring protein FliF  33.12 
 
 
574 aa  248  2e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  33.53 
 
 
567 aa  247  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  31.49 
 
 
592 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3846  flagellar MS-ring protein  37.24 
 
 
532 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184331  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  30.05 
 
 
598 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  31.68 
 
 
584 aa  246  6e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  29.93 
 
 
597 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2559  flagellar M-ring protein FliF  39.33 
 
 
533 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00858256  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  32.59 
 
 
568 aa  246  9e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  34.26 
 
 
519 aa  245  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1394  flagellar M-ring protein FliF  40.54 
 
 
533 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0124624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>