More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0704 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0704  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 214 aa  441  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.753304  normal  0.399327 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  96.28 
 
 		 215 aa  425  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  70 
 
 		 210 aa  296  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  69.05 
 
 		 210 aa  293  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  67.29 
 
 		 212 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  67.29 
 
 		 212 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  67.29 
 
 		 212 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  67.29 
 
 		 212 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  67.29 
 
 		 212 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  67.29 
 
 		 212 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  67.29 
 
 		 212 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  67.29 
 
 		 212 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  67.13 
 
 		 214 aa  280  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  66.82 
 
 		 212 aa  279  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  66.82 
 
 		 212 aa  279  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  66.82 
 
 		 212 aa  279  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  66.82 
 
 		 212 aa  279  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  66.82 
 
 		 212 aa  279  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  67.13 
 
 		 214 aa  278  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  66.67 
 
 		 214 aa  278  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  66.36 
 
 		 212 aa  277  9e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  67.3 
 
 		 212 aa  277  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  68.78 
 
 		 210 aa  274  7e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  68.29 
 
 		 211 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  67.8 
 
 		 211 aa  271  6e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  63.9 
 
 		 208 aa  263  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  65.5 
 
 		 207 aa  262  4e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.2 
 
 		 208 aa  259  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  65.2 
 
 		 208 aa  259  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  63.11 
 
 		 208 aa  259  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  63.18 
 
 		 207 aa  257  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.44 
 
 		 210 aa  256  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  63.24 
 
 		 216 aa  255  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  60.98 
 
 		 208 aa  254  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  61.46 
 
 		 208 aa  254  8e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  61.19 
 
 		 208 aa  248  5e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  51.5 
 
 		 202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.03 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.19 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 212 aa  174  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  48.73 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  45.27 
 
 		 205 aa  168  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  46.43 
 
 		 198 aa  168  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  42.36 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3745  response regulator receiver protein  44.5 
 
 		 203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  44.5 
 
 		 205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 208 aa  161  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  42.42 
 
 		 205 aa  161  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0209  two component LuxR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 201 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4829  response regulator receiver protein  47 
 
 		 209 aa  159  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352064  normal  0.347274 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  44.06 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2579  response regulator FixJ  45.41 
 
 		 205 aa  158  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 203 aa  158  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2491  LuxR response regulator receiver  42.03 
 
 		 211 aa  157  8e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 210 aa  157  9e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.33 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0872  two component LuxR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5152  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.27 
 
 		 207 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341934  normal  0.483556 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 210 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 241 aa  155  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 210 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  40.51 
 
 		 205 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  39.7 
 
 		 205 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  38.92 
 
 		 205 aa  154  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  43.15 
 
 		 205 aa  154  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 240 aa  154  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  44.22 
 
 		 204 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  42.42 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1717  two component LuxR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  41.54 
 
 		 250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4653  two component LuxR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 209 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 203 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4652  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.398364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  42.93 
 
 		 1483 aa  150  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3850  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0530  two component LuxR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.5 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.86 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1685  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.54 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  40.4 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3365  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.58 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  41.03 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1878  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.49 
 
 		 208 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  38.94 
 
 		 212 aa  148  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>