More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2253 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  100 
 
 		 674 aa  1368    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  42.79 
 
 		 1156 aa  464  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  42.79 
 
 		 651 aa  464  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  42.79 
 
 		 651 aa  464  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  42.35 
 
 		 652 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  41.52 
 
 		 689 aa  445  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  40.7 
 
 		 668 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  41.65 
 
 		 640 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  41.14 
 
 		 669 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  40.32 
 
 		 671 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  41.51 
 
 		 667 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  38.47 
 
 		 683 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  43.13 
 
 		 684 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  38.66 
 
 		 684 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  38.66 
 
 		 684 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  40.52 
 
 		 620 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  39.16 
 
 		 656 aa  389  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  39.01 
 
 		 641 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  32.48 
 
 		 688 aa  295  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1504  peptidase U35 phage prohead HK97  40.67 
 
 		 696 aa  244  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1173  peptidase U35 phage prohead HK97  38.32 
 
 		 687 aa  238  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0807  peptidase U35, phage prohead HK97  33.07 
 
 		 689 aa  212  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0140399 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2988  peptidase U35 phage prohead HK97  33.91 
 
 		 600 aa  191  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0734  hypothetical protein  32.5 
 
 		 624 aa  186  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.747813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4683  peptidase U35 phage prohead HK97  31.84 
 
 		 693 aa  177  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0137  peptidase U35, phage prohead HK97  33.52 
 
 		 586 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1844  peptidase U35, phage prohead HK97  32.78 
 
 		 612 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2821  peptidase U35, phage prohead HK97  30.86 
 
 		 599 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.445416 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2017  peptidase S14, ClpP  32.75 
 
 		 391 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  36.65 
 
 		 257 aa  132  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  36.65 
 
 		 257 aa  132  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  37.7 
 
 		 361 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  37.1 
 
 		 258 aa  125  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  36.92 
 
 		 247 aa  123  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  34.26 
 
 		 381 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  34.36 
 
 		 227 aa  116  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  39.76 
 
 		 280 aa  115  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  39.08 
 
 		 280 aa  115  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  39.08 
 
 		 280 aa  115  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  39.88 
 
 		 280 aa  115  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  39.51 
 
 		 287 aa  115  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  35.85 
 
 		 251 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  40.7 
 
 		 280 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  35.18 
 
 		 251 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  35.18 
 
 		 251 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  40.12 
 
 		 282 aa  112  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  34.91 
 
 		 387 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  36.82 
 
 		 244 aa  110  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  34.74 
 
 		 247 aa  110  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  34.58 
 
 		 248 aa  108  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  26.6 
 
 		 1179 aa  108  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  37.04 
 
 		 237 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  40.74 
 
 		 179 aa  107  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  39.38 
 
 		 284 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  35.51 
 
 		 247 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  37.84 
 
 		 247 aa  106  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  31.44 
 
 		 383 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  35.76 
 
 		 197 aa  103  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  36.63 
 
 		 351 aa  103  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  41.86 
 
 		 230 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  39.38 
 
 		 284 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  34.32 
 
 		 281 aa  99  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  32.8 
 
 		 216 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  34.54 
 
 		 365 aa  96.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3693  peptidase U35 phage prohead HK97  29.35 
 
 		 623 aa  96.3  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.854012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  31.86 
 
 		 564 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  31.34 
 
 		 234 aa  92.4  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4464  ClpP protease  35.08 
 
 		 282 aa  90.9  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000555404 
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  35.8 
 
 		 242 aa  90.1  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  37.42 
 
 		 279 aa  87.8  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  32.8 
 
 		 260 aa  87.4  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  36.81 
 
 		 279 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  35.71 
 
 		 345 aa  86.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  33.18 
 
 		 229 aa  85.9  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  38.04 
 
 		 229 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  38.04 
 
 		 229 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0013  putative endopeptidase  34.71 
 
 		 243 aa  82  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2895  hypothetical protein  28.57 
 
 		 780 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294746  normal  0.115998 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4104  hypothetical protein  27.91 
 
 		 780 aa  80.5  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.241188  hitchhiker  0.00000455775 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  33.53 
 
 		 284 aa  79.7  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2696  hypothetical protein  28.47 
 
 		 770 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1253  peptidase S14, ClpP  37.65 
 
 		 226 aa  77  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5772  peptidase S14 ClpP  34.32 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  35.88 
 
 		 243 aa  73.6  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  36.42 
 
 		 242 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0535  hypothetical protein  25.93 
 
 		 382 aa  72  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.860861  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1785  hypothetical protein  27.05 
 
 		 591 aa  67.8  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28390  protease subunit of ATP-dependent protease  33.58 
 
 		 197 aa  65.9  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10817 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1845  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  32.59 
 
 		 198 aa  65.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000342072  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0934  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  28.99 
 
 		 209 aa  65.5  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.593149  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1440  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.79 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.53484  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2021  peptidase S14, ClpP  36.14 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2057  peptidase S14 ClpP  36.14 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1059  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.5 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.027363  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5312  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.59 
 
 		 193 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5687  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.59 
 
 		 193 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0203  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.59 
 
 		 193 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0232  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.59 
 
 		 193 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.798089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4944  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.59 
 
 		 193 aa  63.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5236  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.59 
 
 		 193 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>