More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1880 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1880  HflC protein  100 
 
 		 299 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0072  HflC protein  82.43 
 
 		 302 aa  507  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.055112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2299  HflC protein  83.28 
 
 		 299 aa  507  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783703  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  81.33 
 
 		 301 aa  509  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2600  HflC protein  85.28 
 
 		 300 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.558304  normal  0.617958 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  82 
 
 		 301 aa  497  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5011  HflC protein  83.05 
 
 		 296 aa  494  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2195  HflC protein  82 
 
 		 301 aa  481  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1432  HflC protein  83.33 
 
 		 299 aa  479  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200171  normal  0.890554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  57.53 
 
 		 296 aa  367  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  59.86 
 
 		 295 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  53.36 
 
 		 304 aa  333  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  53.54 
 
 		 300 aa  332  6e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  53.12 
 
 		 303 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  54.15 
 
 		 304 aa  316  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  52.23 
 
 		 295 aa  315  5e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  53.36 
 
 		 304 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  50.17 
 
 		 289 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  49.66 
 
 		 289 aa  306  3e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  50.34 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  48.46 
 
 		 292 aa  289  3e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  48.29 
 
 		 293 aa  279  3e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  50.55 
 
 		 294 aa  276  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  44.13 
 
 		 284 aa  232  6e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5105  membrane protein, HflC  40.48 
 
 		 299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  39.07 
 
 		 289 aa  212  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1742  HflC protein  39.93 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1828  HflC protein  39.93 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540549  normal  0.180131 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1715  HflC protein  39.93 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1804  HflC protein  39.58 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266909  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6275  HflC protein  39.58 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364844  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  41.2 
 
 		 304 aa  209  7e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  39.45 
 
 		 298 aa  206  5e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  36.59 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  37.98 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2533  band 7 protein  40 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00510027  hitchhiker  0.0000246325 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1471  band 7 protein  37.25 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0967739  normal  0.234957 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2242  HflC protein  40.83 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.564384  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  36.55 
 
 		 291 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1602  FtsH protease activity modulator HflC  38.85 
 
 		 300 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155202  normal  0.359083 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1412  band 7 protein  39.11 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.0000177218 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  38.06 
 
 		 294 aa  192  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  35.47 
 
 		 292 aa  192  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  37.59 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  36.07 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  36.71 
 
 		 295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  35.81 
 
 		 292 aa  189  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  38.29 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  36.82 
 
 		 292 aa  187  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  39.13 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1337  ftsH protease activity modulator HflC  39.24 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127713  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2181  HflC protein  39.24 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0070  ftsH protease activity modulator HflC  39.24 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216158  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2346  HflC protein  39.24 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2219  HflC protein  39.24 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1826  ftsH protease activity modulator HflC  39.24 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  36.33 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  36.33 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  34.8 
 
 		 292 aa  187  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  39.58 
 
 		 281 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  35.43 
 
 		 297 aa  185  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  35.67 
 
 		 297 aa  185  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  35.49 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  40.14 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  34.59 
 
 		 293 aa  182  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  37.63 
 
 		 284 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  37.54 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  35.99 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  37.19 
 
 		 289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  38.03 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  37.55 
 
 		 292 aa  179  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2010  HflC protein  39.38 
 
 		 293 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0721507  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  37.87 
 
 		 289 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  35.66 
 
 		 291 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  34.33 
 
 		 297 aa  179  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  35.93 
 
 		 335 aa  177  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  35.19 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  34.69 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  35.17 
 
 		 334 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  35.17 
 
 		 334 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  37.88 
 
 		 293 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  35.17 
 
 		 334 aa  176  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  34.67 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  34.67 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  34.67 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  34.67 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  36.1 
 
 		 295 aa  176  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  34.27 
 
 		 331 aa  176  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  36.95 
 
 		 308 aa  176  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  35.53 
 
 		 300 aa  175  7e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  31.36 
 
 		 289 aa  175  7e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  37.28 
 
 		 295 aa  175  9e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  38.15 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  37.32 
 
 		 290 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  37.32 
 
 		 290 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  37.98 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002262  HflC protein  35.42 
 
 		 326 aa  172  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00114995  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0358  FtsH protease regulator HflC  34.07 
 
 		 334 aa  172  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  hitchhiker  0.00397927 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1786  integral membrane proteinase  35.64 
 
 		 287 aa  172  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00091  serine protease  34.47 
 
 		 326 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>