More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0602 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  72.09 
 
 		 218 aa  327  6e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8629  transcriptional regulator, GntR family  65.44 
 
 		 223 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1044  transcriptional regulator  34.45 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000547437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  37.69 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  36.67 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 233 aa  115  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0179  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  36.46 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 228 aa  108  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 231 aa  104  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  35.05 
 
 		 223 aa  94  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 223 aa  94  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6620  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0364591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 211 aa  92.4  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0982  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 222 aa  92  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84517 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 234 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 223 aa  90.9  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 228 aa  89  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 233 aa  89  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 228 aa  89  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 228 aa  88.6  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 226 aa  88.6  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  88.2  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 214 aa  88.2  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  26.51 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 230 aa  86.7  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  34.01 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  34.01 
 
 		 233 aa  86.3  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3215  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 256 aa  86.3  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 232 aa  86.3  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 221 aa  85.9  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 217 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 222 aa  85.5  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.35 
 
 		 229 aa  85.1  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.35 
 
 		 229 aa  85.1  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 252 aa  84.7  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 223 aa  84.7  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  29.9 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  31.79 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  30.15 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4366  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  26.5 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5559  transcriptional regulator GntR family  31.28 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4402  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.225327  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4647  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  30.46 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2360  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68775 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0845  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0010  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  hitchhiker  0.00449189 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5262  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  25.25 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1138  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128923 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  32.29 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  30.46 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3493  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.671641 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0240  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>