166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2624 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 197 aa  403  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  65.13 
 
 		 196 aa  265  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  62.24 
 
 		 196 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  67.35 
 
 		 197 aa  264  8e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  65.31 
 
 		 204 aa  257  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  65.82 
 
 		 204 aa  257  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  64.29 
 
 		 204 aa  251  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  60.71 
 
 		 200 aa  248  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  63.08 
 
 		 197 aa  247  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  58.46 
 
 		 196 aa  238  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  58.97 
 
 		 195 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  58.97 
 
 		 195 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  51.79 
 
 		 197 aa  208  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  49.24 
 
 		 195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  44.61 
 
 		 200 aa  167  9e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  47 
 
 		 201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  47.26 
 
 		 205 aa  160  9e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  44.56 
 
 		 200 aa  158  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  44.56 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  41.84 
 
 		 200 aa  153  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  43.01 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  44.56 
 
 		 203 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  45.32 
 
 		 201 aa  151  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  39.9 
 
 		 201 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0315  hypothetical protein  42.05 
 
 		 201 aa  147  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.599326 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  39.39 
 
 		 201 aa  148  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  38.89 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  38.58 
 
 		 206 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5151  hypothetical protein  41.18 
 
 		 210 aa  143  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758473 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  42.42 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  37.56 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  38.38 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  37.06 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  34.01 
 
 		 219 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  37.06 
 
 		 200 aa  130  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  37.19 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  37.82 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  34.52 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  39.34 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  37 
 
 		 197 aa  125  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  39.11 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  38.12 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  34.65 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  38.86 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  34.85 
 
 		 201 aa  122  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  35.2 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4931  DSBA oxidoreductase  36.18 
 
 		 199 aa  117  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  38.42 
 
 		 208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  37.37 
 
 		 208 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  37.37 
 
 		 208 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  39.57 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  39.9 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  34.34 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  33.85 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  37.7 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  31.63 
 
 		 201 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  37.76 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  32 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  35.52 
 
 		 201 aa  108  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0100  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  34.5 
 
 		 201 aa  108  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.243641 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  34.92 
 
 		 204 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  31.5 
 
 		 207 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  35.14 
 
 		 212 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  32.29 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  34.69 
 
 		 210 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5394  DSBA oxidoreductase  34.59 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5467  DSBA oxidoreductase  34.59 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0340236  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  34.65 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  34.59 
 
 		 212 aa  104  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0187  DSBA oxidoreductase  35.14 
 
 		 212 aa  104  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  32.32 
 
 		 201 aa  104  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  34.59 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0608  DSBA oxidoreductase  37.95 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  30.5 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4802  DSBA oxidoreductase  32.97 
 
 		 212 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0479  DSBA oxidoreductase  33.84 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  35.68 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0222  DSBA oxidoreductase  36.89 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  31.47 
 
 		 209 aa  99  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  29.84 
 
 		 218 aa  99  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  34.38 
 
 		 200 aa  97.8  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  33.69 
 
 		 212 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  29.5 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  29 
 
 		 208 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5568  DSBA oxidoreductase  31.63 
 
 		 198 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0083  DSBA oxidoreductase  33.86 
 
 		 223 aa  95.5  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0411784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5961  DSBA oxidoreductase  32.52 
 
 		 211 aa  94.7  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 203 aa  94.4  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1390  DSBA oxidoreductase  35.98 
 
 		 232 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00141956  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1326  DSBA oxidoreductase  35.08 
 
 		 232 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3344  DSBA oxidoreductase  32.14 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3669  DSBA oxidoreductase  32.14 
 
 		 218 aa  92  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  32.62 
 
 		 212 aa  91.7  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3034  DSBA oxidoreductase  31.66 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3822  DSBA oxidoreductase  32.32 
 
 		 199 aa  89  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3753  DSBA oxidoreductase  31.16 
 
 		 217 aa  89  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.819118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>