More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_2033 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  100 
 
 
293 aa  596  1e-169  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  59.13 
 
 
286 aa  311  6.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  54.1 
 
 
285 aa  265  8e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  46.88 
 
 
285 aa  256  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  39.93 
 
 
283 aa  192  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  42.22 
 
 
294 aa  185  7e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  41.88 
 
 
312 aa  181  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  41.1 
 
 
306 aa  181  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  41.2 
 
 
272 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  34.75 
 
 
282 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  43.68 
 
 
336 aa  139  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  37.07 
 
 
290 aa  139  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  33.83 
 
 
271 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  34.04 
 
 
282 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  33.22 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  35.69 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  36.51 
 
 
277 aa  133  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  33.22 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  33.47 
 
 
274 aa  130  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  32.67 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  33.07 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  37.67 
 
 
282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  32.67 
 
 
275 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  32.67 
 
 
275 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  39.52 
 
 
313 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  32.67 
 
 
273 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  40.59 
 
 
336 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  39.44 
 
 
280 aa  123  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  39.7 
 
 
279 aa  123  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  41.42 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  36.49 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  37.7 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  39.63 
 
 
285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  36.78 
 
 
282 aa  116  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  37.38 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  39.87 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  32.81 
 
 
331 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  31.54 
 
 
300 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  39.63 
 
 
272 aa  113  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  35.04 
 
 
289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  30.82 
 
 
300 aa  112  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  33.18 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  35.98 
 
 
322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  37.5 
 
 
296 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  34.81 
 
 
287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  29.2 
 
 
268 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  39.34 
 
 
281 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  34.81 
 
 
286 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  37.07 
 
 
299 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  38.74 
 
 
278 aa  105  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  42.64 
 
 
303 aa  105  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2646  peptidase M23B  31.05 
 
 
287 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  41.04 
 
 
316 aa  105  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  41.98 
 
 
284 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  37.44 
 
 
367 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  30.74 
 
 
332 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  30.53 
 
 
328 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  29.31 
 
 
286 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  38.36 
 
 
282 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  36.93 
 
 
276 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2524  peptidase M23B  35 
 
 
287 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2423  peptidase M23B  35.06 
 
 
306 aa  102  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  36.18 
 
 
296 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  36.41 
 
 
255 aa  102  8e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  36.18 
 
 
263 aa  102  9e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  44.19 
 
 
309 aa  102  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  35.06 
 
 
301 aa  102  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  35.06 
 
 
306 aa  102  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.71 
 
 
305 aa  102  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  33.89 
 
 
313 aa  102  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  37.11 
 
 
312 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  37.11 
 
 
282 aa  101  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2531  peptidase M23B  37.11 
 
 
312 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  41.54 
 
 
319 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  41.54 
 
 
321 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  33.33 
 
 
302 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  36.48 
 
 
311 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  40.77 
 
 
318 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  31 
 
 
266 aa  99.8  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  26.99 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  36.36 
 
 
363 aa  99.4  7e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  36.14 
 
 
395 aa  99.4  7e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0630  peptidase M23B  37.25 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0558086 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  39.87 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  38.06 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  39.07 
 
 
379 aa  97.1  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  33.02 
 
 
232 aa  97.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  30.57 
 
 
244 aa  97.1  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1776  Peptidase M23  41.67 
 
 
434 aa  97.1  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  42.06 
 
 
375 aa  97.1  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  42.64 
 
 
320 aa  96.3  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  32 
 
 
273 aa  96.3  5e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  42.64 
 
 
402 aa  95.9  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  44.09 
 
 
141 aa  95.5  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  42.97 
 
 
321 aa  95.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  36.75 
 
 
524 aa  94.7  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  43.51 
 
 
313 aa  94.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  40.6 
 
 
305 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  44.19 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  40.6 
 
 
305 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>