51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2356 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
453 aa  933    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  29.43 
 
 
451 aa  103  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  36.02 
 
 
197 aa  95.5  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  30.05 
 
 
193 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  27.04 
 
 
209 aa  84  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  24.05 
 
 
1140 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  24.82 
 
 
451 aa  79.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  24.71 
 
 
1145 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  30.85 
 
 
231 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  32.12 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  25.62 
 
 
452 aa  74.3  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  26.29 
 
 
214 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  28.09 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  26.18 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  22.95 
 
 
453 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  25.39 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  27.06 
 
 
261 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  27.37 
 
 
198 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  28.72 
 
 
1444 aa  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  26.57 
 
 
222 aa  63.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  28.49 
 
 
326 aa  63.2  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  28.23 
 
 
239 aa  62.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  29.21 
 
 
455 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  31.21 
 
 
308 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  28 
 
 
198 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1383  hypothetical protein  27.65 
 
 
218 aa  59.3  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  27.39 
 
 
260 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  24.73 
 
 
217 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  24.27 
 
 
501 aa  57.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  26.19 
 
 
238 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  27.27 
 
 
234 aa  57.4  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  27.03 
 
 
242 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  26.73 
 
 
237 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  27.31 
 
 
230 aa  54.3  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  27.05 
 
 
241 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  25.7 
 
 
211 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  32.58 
 
 
239 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  31.21 
 
 
831 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  23.7 
 
 
234 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  26.16 
 
 
247 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  22.8 
 
 
212 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  28.51 
 
 
240 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.03 
 
 
1505 aa  47.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  24.88 
 
 
240 aa  47.4  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4607  hypothetical protein  26.42 
 
 
276 aa  47  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  26.03 
 
 
558 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  28.18 
 
 
321 aa  45.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6337  protein of unknown function DUF1080  25 
 
 
218 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.975208  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0966  protein of unknown function DUF1080  22.31 
 
 
259 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0225828 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  25.78 
 
 
1194 aa  43.5  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3175  protein of unknown function DUF1080  23.58 
 
 
258 aa  43.1  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>