142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2238 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2238  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 862 aa  1761    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  36.81 
 
 		 730 aa  95.9  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  35.77 
 
 		 681 aa  82.4  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  27.06 
 
 		 800 aa  78.6  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  32.91 
 
 		 744 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  32.21 
 
 		 730 aa  71.6  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  32.54 
 
 		 815 aa  71.6  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  35.29 
 
 		 826 aa  69.7  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  27.71 
 
 		 754 aa  68.6  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  29.79 
 
 		 671 aa  68.6  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  32.68 
 
 		 774 aa  67  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  30.67 
 
 		 862 aa  66.6  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  28.18 
 
 		 763 aa  64.3  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  31.75 
 
 		 827 aa  63.9  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  38.71 
 
 		 672 aa  63.5  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  28.43 
 
 		 763 aa  63.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  43.24 
 
 		 668 aa  62.8  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  30.97 
 
 		 677 aa  62  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  29.89 
 
 		 890 aa  61.6  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  35.11 
 
 		 706 aa  61.6  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  24.09 
 
 		 725 aa  61.6  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  25.27 
 
 		 728 aa  60.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  30.22 
 
 		 815 aa  60.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0440  transglutaminase domain protein  23.95 
 
 		 748 aa  60.8  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  30.46 
 
 		 840 aa  60.8  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  26 
 
 		 742 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  36.47 
 
 		 676 aa  60.1  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  30.65 
 
 		 806 aa  60.1  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  28.81 
 
 		 720 aa  60.1  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1077  transglutaminase domain protein  25.13 
 
 		 770 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785713 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  24.1 
 
 		 742 aa  58.2  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  32.31 
 
 		 668 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  28.68 
 
 		 709 aa  58.2  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  27.82 
 
 		 732 aa  57  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  35.63 
 
 		 645 aa  57.4  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  25.3 
 
 		 790 aa  57  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  25.83 
 
 		 726 aa  57  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  25.28 
 
 		 742 aa  57  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  25.84 
 
 		 742 aa  57.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  33.6 
 
 		 788 aa  56.6  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  25.84 
 
 		 742 aa  57  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  32.85 
 
 		 634 aa  56.2  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  25.69 
 
 		 760 aa  56.6  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  30.36 
 
 		 800 aa  56.6  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  25.27 
 
 		 742 aa  55.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  25.27 
 
 		 742 aa  55.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  25.27 
 
 		 742 aa  56.2  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  25.27 
 
 		 742 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0413  transglutaminase domain-containing protein  30.86 
 
 		 507 aa  55.8  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.939018 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  29.7 
 
 		 790 aa  55.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  34.48 
 
 		 705 aa  55.8  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  35.63 
 
 		 653 aa  55.8  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  28 
 
 		 691 aa  55.8  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  27.27 
 
 		 674 aa  55.5  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  40.54 
 
 		 632 aa  55.1  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  39.29 
 
 		 644 aa  54.7  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  31.54 
 
 		 662 aa  54.7  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  33.71 
 
 		 656 aa  54.3  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  36.78 
 
 		 684 aa  53.9  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  31.2 
 
 		 661 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  31.25 
 
 		 737 aa  54.3  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  36.67 
 
 		 680 aa  53.9  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  35.92 
 
 		 673 aa  54.3  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  26.37 
 
 		 635 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  31.82 
 
 		 667 aa  53.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  37.84 
 
 		 943 aa  53.5  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  25.53 
 
 		 795 aa  53.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1290  transglutaminase domain-containing protein  35.37 
 
 		 866 aa  52.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19935  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  28.57 
 
 		 739 aa  52.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  28.57 
 
 		 739 aa  52.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  39.19 
 
 		 632 aa  52.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  39.73 
 
 		 692 aa  52  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  40.54 
 
 		 635 aa  52.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  30 
 
 		 633 aa  52.4  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  34.38 
 
 		 637 aa  52.4  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  30 
 
 		 662 aa  52  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  27.73 
 
 		 715 aa  52  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2905  transglutaminase domain protein  21.59 
 
 		 769 aa  52  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  34.21 
 
 		 631 aa  52  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  29.17 
 
 		 676 aa  51.6  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  27.07 
 
 		 715 aa  51.6  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  27.86 
 
 		 696 aa  51.6  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  38.1 
 
 		 644 aa  51.6  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  27.73 
 
 		 715 aa  51.6  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  28.78 
 
 		 825 aa  51.6  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  30.89 
 
 		 662 aa  51.2  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  28.57 
 
 		 850 aa  51.2  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1293  transglutaminase domain protein  32.41 
 
 		 803 aa  51.2  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269788  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  25.56 
 
 		 667 aa  51.2  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  37.84 
 
 		 641 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  27.73 
 
 		 730 aa  50.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  34.12 
 
 		 689 aa  50.4  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3804  transglutaminase domain-containing protein  24.69 
 
 		 820 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0581  transglutaminase-like domain-containing protein  24.52 
 
 		 1238 aa  50.1  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  35.14 
 
 		 681 aa  50.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  27.73 
 
 		 707 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  33.78 
 
 		 639 aa  50.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  28.57 
 
 		 734 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1334  transglutaminase domain protein  34.15 
 
 		 859 aa  50.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000357459 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  28.57 
 
 		 734 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>