174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2352 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  100 
 
 		 721 aa  1482    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  29.66 
 
 		 782 aa  286  9e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3659  integrase catalytic subunit  31.64 
 
 		 785 aa  269  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  25.52 
 
 		 618 aa  151  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  25.52 
 
 		 618 aa  151  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  26.85 
 
 		 650 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  28.21 
 
 		 653 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  28.34 
 
 		 618 aa  147  6e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  27.06 
 
 		 625 aa  144  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  25.71 
 
 		 556 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  25.71 
 
 		 556 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  25.71 
 
 		 556 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  25.71 
 
 		 556 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  26.94 
 
 		 677 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  26.94 
 
 		 652 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  26.94 
 
 		 652 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  26.94 
 
 		 652 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  29.93 
 
 		 548 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  28.64 
 
 		 810 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  25.95 
 
 		 575 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  25.95 
 
 		 662 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  25.95 
 
 		 662 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  26.04 
 
 		 595 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  27.39 
 
 		 630 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  26.88 
 
 		 617 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  27.06 
 
 		 649 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  25.81 
 
 		 617 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  25.85 
 
 		 611 aa  127  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  27.04 
 
 		 626 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 547 aa  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  30.12 
 
 		 541 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  30.12 
 
 		 541 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  30.12 
 
 		 541 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  30.12 
 
 		 541 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  28.4 
 
 		 551 aa  124  9e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  29.1 
 
 		 636 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  27.35 
 
 		 640 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  29.1 
 
 		 640 aa  121  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  30.2 
 
 		 670 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  26.65 
 
 		 733 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  25.05 
 
 		 616 aa  117  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  29.58 
 
 		 632 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  26.93 
 
 		 552 aa  117  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  26.01 
 
 		 509 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  26.01 
 
 		 572 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  26.01 
 
 		 562 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  28.73 
 
 		 640 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  28.73 
 
 		 640 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0028  transposase  25.49 
 
 		 651 aa  114  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.680566  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  29.14 
 
 		 626 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  25.78 
 
 		 560 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  27.66 
 
 		 636 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  25.13 
 
 		 422 aa  107  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  29.39 
 
 		 547 aa  107  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  25.48 
 
 		 599 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  25.48 
 
 		 599 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  31.48 
 
 		 900 aa  104  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  31.48 
 
 		 900 aa  104  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  31.88 
 
 		 497 aa  102  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  25.65 
 
 		 614 aa  100  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1859  integrase catalytic subunit  29.84 
 
 		 791 aa  99  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  28.37 
 
 		 382 aa  98.2  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  24.39 
 
 		 704 aa  97.8  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0246  Integrase catalytic region  25.9 
 
 		 717 aa  97.4  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.337678 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  27.47 
 
 		 550 aa  94.7  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  26.52 
 
 		 554 aa  92.8  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  27.18 
 
 		 542 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  22.7 
 
 		 480 aa  92  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  22.7 
 
 		 480 aa  92  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  28.51 
 
 		 536 aa  90.9  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  26 
 
 		 481 aa  90.9  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5778  integrase catalytic region  32.47 
 
 		 662 aa  90.5  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  27.71 
 
 		 902 aa  90.5  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  26.51 
 
 		 555 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  26 
 
 		 481 aa  89  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1495  integrase catalytic region  31.17 
 
 		 657 aa  88.6  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170756 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  24.93 
 
 		 497 aa  88.2  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  24.93 
 
 		 497 aa  88.2  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  24.93 
 
 		 497 aa  88.2  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0151  hypothetical protein  32.47 
 
 		 456 aa  87.8  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  26.33 
 
 		 567 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1659  Integrase catalytic region  25.13 
 
 		 922 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0175  Tn7-like transposition protein B  26.91 
 
 		 716 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  26.26 
 
 		 468 aa  85.5  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2538  hypothetical protein  23.65 
 
 		 762 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3827  transposon Tn7 transposition protein TnsB  24.53 
 
 		 696 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111993 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2453  Integrase catalytic region  26.9 
 
 		 917 aa  84.7  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.481095  hitchhiker  0.00214195 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  25.69 
 
 		 560 aa  83.6  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3214  hypothetical protein  23.32 
 
 		 780 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.262924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2088  hypothetical protein  22.61 
 
 		 749 aa  81.6  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3210  integrase catalytic subunit  22.68 
 
 		 782 aa  82  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  28.42 
 
 		 581 aa  81.3  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3935  putative transposase  32.97 
 
 		 697 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1983  TnsA endonuclease  25.91 
 
 		 886 aa  80.5  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.176363 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0221  Tn7-like transposition protein B  25.48 
 
 		 728 aa  79  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.26166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3365  Integrase catalytic region  29.18 
 
 		 718 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.582921  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  28.46 
 
 		 561 aa  78.2  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7026  Tn7-like transposition protein B  27.31 
 
 		 735 aa  77  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.314697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1116  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  23.09 
 
 		 721 aa  77  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6966  hypothetical protein  25.48 
 
 		 728 aa  77  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>