More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1462 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 		 194 aa  384  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  62.3 
 
 		 186 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  57.38 
 
 		 186 aa  214  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  60.11 
 
 		 186 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  60.66 
 
 		 186 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  58.38 
 
 		 186 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  58.56 
 
 		 186 aa  210  9e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  57.84 
 
 		 188 aa  208  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  57.84 
 
 		 188 aa  208  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  57.3 
 
 		 188 aa  206  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  59.89 
 
 		 180 aa  204  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  58.56 
 
 		 201 aa  204  9e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  58.56 
 
 		 193 aa  203  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  56.35 
 
 		 186 aa  203  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  57.63 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  56.5 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  56.5 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  53.3 
 
 		 190 aa  182  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  52.75 
 
 		 190 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  52.46 
 
 		 189 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  53.98 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  50 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  49.73 
 
 		 189 aa  169  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0606  ATP synthase F1, delta subunit  53.93 
 
 		 190 aa  165  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226386  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  50.56 
 
 		 190 aa  162  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  51.4 
 
 		 188 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  52.02 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.5 
 
 		 190 aa  157  9e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  44.89 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  44.89 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  41.48 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  46.02 
 
 		 217 aa  148  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  45.21 
 
 		 196 aa  145  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  49.43 
 
 		 179 aa  145  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  45.45 
 
 		 186 aa  141  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  39.77 
 
 		 186 aa  135  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0111  ATP synthase F1, delta subunit  40.98 
 
 		 194 aa  131  5e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  40 
 
 		 197 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  43.1 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1316  ATP synthase F1, delta subunit  40.45 
 
 		 198 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.665716 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.92 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.71 
 
 		 179 aa  106  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  36 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.06 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  30.64 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.68 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.86 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.91 
 
 		 180 aa  98.2  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 		 180 aa  95.9  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 		 181 aa  91.3  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.76 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06287  ATP synthase oligomycin sensitivity conferral protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12400)  32.8 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.822341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.43 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.94 
 
 		 182 aa  89  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  33.14 
 
 		 182 aa  87.8  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.86 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  30.51 
 
 		 178 aa  86.7  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3077  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.09 
 
 		 178 aa  86.3  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26673  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.75 
 
 		 183 aa  85.9  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.53 
 
 		 181 aa  85.9  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.15 
 
 		 185 aa  85.1  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.15 
 
 		 185 aa  85.1  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.67 
 
 		 182 aa  85.1  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 		 180 aa  84.7  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.58 
 
 		 180 aa  84.7  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  33.53 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  28 
 
 		 176 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.32 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.38 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.4 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  28.57 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_006686  CND03280  conserved hypothetical protein  28.02 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.9 
 
 		 180 aa  80.9  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.93 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  29.05 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_500  ATP synthase F1, delta subunit  29.17 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0258764  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.92 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0561  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.17 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.132233  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44603  predicted protein  29.24 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  29.24 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.67 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00560737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.8 
 
 		 178 aa  77.8  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32540  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  28.02 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3285  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.83 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  31.58 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  26.01 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.28 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163792  normal  0.702124 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  30.06 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0094  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.28 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.01 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  30.17 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.46 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.85 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.39 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0119  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.17 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2952  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.17 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226604  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.17 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0559682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>