More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0254 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  100 
 
 		 136 aa  268  2e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  76.15 
 
 		 130 aa  203  5e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  53.91 
 
 		 135 aa  136  7.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  43.97 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  40.17 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  46.3 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  39.06 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  41.53 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  46.3 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  45.83 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  39.37 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  45.38 
 
 		 688 aa  92.8  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  49.48 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  45.22 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  40.68 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  38.14 
 
 		 135 aa  90.5  7e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  41.67 
 
 		 142 aa  90.5  8e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  44.54 
 
 		 688 aa  90.5  8e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  37.8 
 
 		 139 aa  90.1  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  41.32 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  38.79 
 
 		 145 aa  87.8  4e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  39.32 
 
 		 142 aa  86.7  9e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  44.35 
 
 		 688 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  38.84 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  40.3 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  42.86 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  40.5 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  38.33 
 
 		 141 aa  83.6  9e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  42.02 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  41.09 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  41.27 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  36.75 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  35.29 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  42.02 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  39.34 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  37.93 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0295  signal-transduction protein  42.74 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  37.82 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  38.17 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  39.84 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  37.29 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0768  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.25 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000458984  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  34.48 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  38.66 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  34.48 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  32.35 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  32.56 
 
 		 626 aa  71.6  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  36.22 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  43.52 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  38.33 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  40.34 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  40.21 
 
 		 689 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0173  signal-transduction protein  42.06 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.06 
 
 		 1344 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0624  signal-transduction protein  35.83 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1806  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.43 
 
 		 574 aa  67.4  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55767  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  34.62 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  38.26 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  36.7 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  32.81 
 
 		 625 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  30.47 
 
 		 641 aa  66.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  36.7 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  31.25 
 
 		 627 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  39.34 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  31.25 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 1643 aa  64.3  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  30.97 
 
 		 646 aa  63.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  33.61 
 
 		 250 aa  63.5  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  33.61 
 
 		 187 aa  63.5  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  36.7 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  39.52 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  32.56 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  38.78 
 
 		 146 aa  62  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  39.52 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  31.75 
 
 		 147 aa  62  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.59 
 
 		 485 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  31.67 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  36.36 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  40 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  34.43 
 
 		 625 aa  61.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  33.63 
 
 		 638 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3348  putative nucleotidyltransferase  33.88 
 
 		 646 aa  61.6  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.351645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  35.16 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2675  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.17 
 
 		 840 aa  60.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0500157  hitchhiker  7.41843e-16 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1391  CBS domain-containing protein  35.78 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  34.65 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2491  signal-transduction protein  37.17 
 
 		 574 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2961  CBS domain-containing proteins  35.78 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.195076  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.11 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  30.58 
 
 		 865 aa  60.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  32.08 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1886  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.71 
 
 		 485 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 		 1274 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0968  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.96 
 
 		 497 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  33.03 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0697  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.17 
 
 		 490 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0725248  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 		 663 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1607  signal-transduction protein  35.78 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0484541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>