More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0860 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  100 
 
 		 309 aa  639    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  67.75 
 
 		 309 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2607  agmatinase  66.34 
 
 		 306 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564715  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  66.45 
 
 		 306 aa  437  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  66.45 
 
 		 306 aa  434  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2059  agmatinase  65.03 
 
 		 309 aa  433  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44506  normal  0.429183 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2278  agmatinase  64.45 
 
 		 310 aa  424  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000267205  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1621  agmatinase  64.38 
 
 		 307 aa  427  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.644078  normal  0.0544255 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  63.96 
 
 		 309 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3972  agmatinase  61.51 
 
 		 306 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3370  agmatinase  62.17 
 
 		 306 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402836  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02767  agmatinase  61.51 
 
 		 306 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0757  agmatinase  61.84 
 
 		 306 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3079  agmatinase  61.84 
 
 		 306 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297049 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02730  hypothetical protein  61.51 
 
 		 306 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3240  agmatinase  61.24 
 
 		 306 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3420  agmatinase  61.24 
 
 		 306 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0247827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3324  agmatinase  61.24 
 
 		 306 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0546446  normal  0.86641 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3316  agmatinase  61.24 
 
 		 306 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3279  agmatinase  61.84 
 
 		 306 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3343  agmatinase  61.84 
 
 		 306 aa  384  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4239  agmatinase  61.84 
 
 		 306 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0774  agmatinase  61.84 
 
 		 306 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3258  agmatinase  61.24 
 
 		 306 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.63142 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3095  agmatinase  61.51 
 
 		 306 aa  384  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  50.81 
 
 		 319 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  50.33 
 
 		 320 aa  310  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  48.86 
 
 		 321 aa  305  7e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  48.86 
 
 		 321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  48.53 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  47.23 
 
 		 322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  49.01 
 
 		 320 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  49.01 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  48.37 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  48.18 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  47.87 
 
 		 322 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3696  agmatinase  47.87 
 
 		 322 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  47.87 
 
 		 322 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  47.7 
 
 		 322 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1941  agmatinase  47.06 
 
 		 320 aa  264  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  46.49 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  45.9 
 
 		 322 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1162  agmatinase  43.79 
 
 		 315 aa  256  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0946  agmatinase  48.06 
 
 		 322 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0860  agmatinase  44.67 
 
 		 318 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.182597 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  44.63 
 
 		 342 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1319  agmatinase  44.15 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1231  agmatinase  43.81 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  44.12 
 
 		 316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1735  agmatinase  44.82 
 
 		 324 aa  242  5e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.252454  normal  0.73109 
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  47.58 
 
 		 316 aa  241  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1675  agmatinase  44.98 
 
 		 317 aa  239  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  44.93 
 
 		 321 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1111  agmatinase  44.26 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0272182 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2909  agmatinase  44.59 
 
 		 321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0784  agmatinase  46.88 
 
 		 293 aa  229  5e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.782566  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2340  agmatinase  45.79 
 
 		 321 aa  226  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  42.12 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3492  putative agmatinase  43.99 
 
 		 330 aa  218  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0949327  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  41.25 
 
 		 319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  41.25 
 
 		 319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  41.25 
 
 		 319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  40.39 
 
 		 315 aa  216  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  41.04 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  37.96 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  40.91 
 
 		 317 aa  211  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  37.79 
 
 		 329 aa  209  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  38.64 
 
 		 321 aa  209  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  36.36 
 
 		 327 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  37.5 
 
 		 320 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  39.44 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  39.09 
 
 		 318 aa  205  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  38.1 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  38.94 
 
 		 310 aa  202  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0346  agmatinase  40.79 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  37.97 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  37.97 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  37.9 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  37.97 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  36.91 
 
 		 378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  38.89 
 
 		 317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  40.33 
 
 		 343 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  40.33 
 
 		 343 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  40.33 
 
 		 345 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33400  agmatinase  39.87 
 
 		 343 aa  198  7.999999999999999e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.294688 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  36.59 
 
 		 354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  41.78 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  40.8 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  37.54 
 
 		 316 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  39.22 
 
 		 333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  38.33 
 
 		 319 aa  195  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  37.87 
 
 		 316 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  38.66 
 
 		 313 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  40.26 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  38.66 
 
 		 313 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  38.66 
 
 		 313 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  39.29 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  37.3 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  36.25 
 
 		 324 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  40.27 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>