140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3459 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  100 
 
 		 244 aa  497  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  28.9 
 
 		 152 aa  74.7  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  46.48 
 
 		 95 aa  73.9  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  46.75 
 
 		 82 aa  73.9  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  27.13 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 847 aa  70.5  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 71 aa  68.9  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  50.79 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  24.62 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  25.26 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  46.43 
 
 		 61 aa  66.2  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  53.73 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  43.66 
 
 		 515 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  43.55 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  26.04 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  32.73 
 
 		 582 aa  62.4  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  35.53 
 
 		 86 aa  62  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  40.91 
 
 		 79 aa  62  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  43.08 
 
 		 103 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  49.15 
 
 		 92 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  40.62 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  37.7 
 
 		 65 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  40.62 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  32.1 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  38.98 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  46.55 
 
 		 62 aa  59.3  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  27.57 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  37.7 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  41.27 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01250  putative stress-responsive transcriptional regulator  38.1 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  35.59 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2824  phage shock protein C, PspC  25.48 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  41.54 
 
 		 70 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 84 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 		 61 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  48.33 
 
 		 64 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  42.37 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  42.37 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  42.37 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  42.37 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  43.1 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  42.37 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 		 127 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  40.68 
 
 		 61 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  38.98 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 		 127 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  40.68 
 
 		 61 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  40.35 
 
 		 178 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  32.76 
 
 		 578 aa  52.8  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1982  phage shock protein C, PspC  36.07 
 
 		 65 aa  52.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161663  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  45 
 
 		 107 aa  52.4  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  37.29 
 
 		 61 aa  52  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  37.29 
 
 		 61 aa  52  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0436  phage shock protein C, PspC  34.25 
 
 		 452 aa  51.6  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000115043  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0588  hypothetical protein  41.07 
 
 		 81 aa  51.2  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.108358  hitchhiker  0.00051768 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00260  putative stress-responsive transcriptional regulator  39.66 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 466 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1273  phage shock protein C, PspC  37.29 
 
 		 58 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2286  hypothetical protein  34.43 
 
 		 65 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  45.45 
 
 		 67 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  38.6 
 
 		 129 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  41.82 
 
 		 70 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  38.03 
 
 		 86 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  40.85 
 
 		 86 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 346 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  37.93 
 
 		 67 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 394 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  36.51 
 
 		 97 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  36.67 
 
 		 114 aa  50.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 66 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  48.94 
 
 		 81 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3790  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 108 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  42.59 
 
 		 512 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  39.66 
 
 		 98 aa  49.3  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0783  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 601 aa  49.3  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  46.55 
 
 		 233 aa  48.9  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  42.62 
 
 		 190 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 		 306 aa  48.9  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3206  phage shock protein C, PspC  37.29 
 
 		 61 aa  48.9  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.849771  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3661  phage shock protein C, PspC  45.28 
 
 		 110 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  24.59 
 
 		 458 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1057  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 64 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.471359  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 76 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  38.71 
 
 		 67 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3719  phage shock protein C, PspC  45.28 
 
 		 110 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0072784  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  38.1 
 
 		 847 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  40.68 
 
 		 59 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  42 
 
 		 547 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  36.23 
 
 		 419 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0686  phage shock protein C, PspC  42.55 
 
 		 96 aa  47.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.920802  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02831  phage shock protein C  40.35 
 
 		 148 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.661382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3802  phage shock protein C, PspC  45.28 
 
 		 110 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0654  phage shock protein C, PspC  32.88 
 
 		 464 aa  46.6  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19259  normal  0.260983 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  38.98 
 
 		 64 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1756  DNA-binding transcriptional activator PspC  40 
 
 		 119 aa  46.6  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  37.5 
 
 		 445 aa  46.6  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0132  phage shock protein C, PspC  31.67 
 
 		 82 aa  46.2  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0723813  normal  0.142504 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>