More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0327 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0327  FecR protein  100 
 
 		 388 aa  799    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2250  FecR protein  42.64 
 
 		 394 aa  319  5e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2245  FecR protein  42.69 
 
 		 396 aa  317  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1501  FecR protein  43.51 
 
 		 375 aa  309  6.999999999999999e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000718034  normal  0.0874984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2882  anti-FecI sigma factor, FecR  42.15 
 
 		 378 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2894  FecR protein  43.44 
 
 		 389 aa  301  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226119 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0955  FecR protein  40.71 
 
 		 383 aa  298  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0724  FecR protein  44.07 
 
 		 391 aa  291  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0709  FecR protein  44.31 
 
 		 398 aa  286  5e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2711  FecR protein  45.45 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1382  FecR protein  38.65 
 
 		 398 aa  277  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1120  FecR protein  43.01 
 
 		 382 aa  277  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.55861  hitchhiker  0.0000759776 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2284  FecR protein  44.81 
 
 		 376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158027 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  40.76 
 
 		 378 aa  273  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0304  FecR protein  38.73 
 
 		 386 aa  272  6e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060234 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0949  FecR protein  40.25 
 
 		 372 aa  268  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  0.208289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3383  FecR protein  40.66 
 
 		 375 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2672  anti-FecI sigma factor, FecR  41.43 
 
 		 386 aa  265  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2138  FecR protein  43.71 
 
 		 378 aa  263  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3790  FecR protein  48.9 
 
 		 392 aa  261  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6732  anti-FecI sigma factor, FecR  37.12 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000497834  normal  0.141975 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3997  FecR protein  45.77 
 
 		 377 aa  256  7e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0715  anti-FecI sigma factor, FecR  36.7 
 
 		 394 aa  255  9e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1355  anti-FecI sigma factor, FecR  39.64 
 
 		 354 aa  253  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5148  anti-FecI sigma factor, FecR  40.6 
 
 		 413 aa  252  9.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114166  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1767  anti-FecI sigma factor, FecR  36.39 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2531  FecR protein  37.28 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6741  anti-FecI sigma factor, FecR  36.5 
 
 		 396 aa  246  6e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1381  anti-FecI sigma factor, FecR  43.63 
 
 		 408 aa  245  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0722919  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4608  anti-FecI sigma factor, FecR  35.1 
 
 		 383 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1660  FecR protein  34.58 
 
 		 408 aa  238  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5112  anti-FecI sigma factor, FecR  39.22 
 
 		 405 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3150  FecR protein  37.96 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0892633  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1363  FecR protein  45.42 
 
 		 373 aa  237  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.864118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1799  FecR protein  35.68 
 
 		 385 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110376 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1585  anti-FecI sigma factor, FecR  37.56 
 
 		 390 aa  236  7e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3990  FecR protein  45.32 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  38.35 
 
 		 384 aa  234  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2646  FecR protein  36.39 
 
 		 383 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0904  FecR protein  41.04 
 
 		 387 aa  232  9e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  hitchhiker  0.000263319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4659  anti-FecI sigma factor, FecR  35.09 
 
 		 430 aa  229  8e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000347403  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2853  FecR protein  42.86 
 
 		 371 aa  229  8e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5341  anti-FecI sigma factor, FecR  42.29 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150121  normal  0.0523863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4177  anti-FecI sigma factor, FecR  40.74 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2856  anti-FecI sigma factor, FecR  35 
 
 		 378 aa  227  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6156  anti-FecI sigma factor, FecR  44.15 
 
 		 391 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.654672  normal  0.21983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4498  anti-FecI sigma factor, FecR  38.02 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1982  FecR protein  36.25 
 
 		 402 aa  223  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  hitchhiker  0.000000845336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3967  FecR protein  39.14 
 
 		 385 aa  222  8e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6426  anti-FecI sigma factor, FecR  38.22 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0583598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4547  anti-FecI sigma factor, FecR  33.67 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.719196  normal  0.0835387 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1037  FecR protein  38.48 
 
 		 408 aa  210  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3047  anti-FecI sigma factor, FecR  34.57 
 
 		 397 aa  209  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2108  anti-FecI sigma factor, FecR  40.19 
 
 		 389 aa  209  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2948  anti-FecI sigma factor, FecR  42.28 
 
 		 398 aa  209  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522825  normal  0.183052 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2723  FecR protein  41.37 
 
 		 380 aa  208  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2079  anti-FecI sigma factor, FecR  39.94 
 
 		 381 aa  206  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0442  FecR protein  34.55 
 
 		 390 aa  203  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3173  FecR protein  32.82 
 
 		 379 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0630959  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3391  FecR protein  34.11 
 
 		 424 aa  179  9e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.335888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1990  FecR protein  38.15 
 
 		 273 aa  176  9e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328209  hitchhiker  0.0000107473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2375  FecR protein  31.54 
 
 		 412 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0596034  normal  0.112561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  34.08 
 
 		 386 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3946  anti-FecI sigma factor, FecR  30.48 
 
 		 351 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1242  FecR protein  28.68 
 
 		 371 aa  150  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0971  anti-FecI sigma factor, FecR  30.29 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  34.58 
 
 		 367 aa  146  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3158  anti-FecI sigma factor, FecR  28.1 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0139  anti-FecI sigma factor, FecR  35.69 
 
 		 381 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3287  anti-FecI sigma factor, FecR  30.1 
 
 		 384 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313343  hitchhiker  0.00186616 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  27.72 
 
 		 392 aa  140  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  31.86 
 
 		 383 aa  139  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0045  anti-FecI sigma factor, FecR  29.04 
 
 		 376 aa  139  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3220  anti-FecI sigma factor, FecR  31.4 
 
 		 385 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3160  anti-FecI sigma factor, FecR  30.58 
 
 		 374 aa  136  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00013248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3198  anti-FecI sigma factor, FecR  28.48 
 
 		 380 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.694273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2262  anti-FecI sigma factor, FecR  29.85 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  27.61 
 
 		 411 aa  126  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  31.14 
 
 		 365 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1405  anti-FecI sigma factor, FecR  34.76 
 
 		 407 aa  116  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  33.33 
 
 		 345 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2668  FecR protein  32.14 
 
 		 361 aa  113  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.153362  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3600  anti-FecI sigma factor, FecR  31.66 
 
 		 323 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.000024232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2094  anti-FecI sigma factor, FecR  30.84 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0059  anti-FecI sigma factor, FecR  32.72 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  29.85 
 
 		 308 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  28.89 
 
 		 376 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2374  anti-FecI sigma factor, FecR  30.41 
 
 		 351 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6792  anti-FecI sigma factor, FecR  27.52 
 
 		 335 aa  99.8  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1889  anti-FecI sigma factor, FecR  28.1 
 
 		 334 aa  97.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3122  anti-FecI sigma factor, FecR  32.02 
 
 		 316 aa  96.7  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0237449  normal  0.801665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  27.84 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1280  FecR protein  31.79 
 
 		 332 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1715  anti-FecI sigma factor, FecR  28.18 
 
 		 324 aa  94  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3204  anti-FecI sigma factor, FecR  30.84 
 
 		 371 aa  93.2  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.619399  normal  0.25037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1588  anti-FecI sigma factor, FecR  29.19 
 
 		 337 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2437  anti-FecI sigma factor, FecR  27.39 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5279  anti-FecI sigma factor, FecR  25.89 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3858  anti-FecI sigma factor, FecR  30.69 
 
 		 282 aa  90.9  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6398  anti-FecI sigma factor, FecR  39.34 
 
 		 412 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>