101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4371 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4371  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 		 419 aa  857    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.931508  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3278  hypothetical protein  72.88 
 
 		 414 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3113  N-acylglucosamine 2-epimerase  72.15 
 
 		 414 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4210  N-acylglucosamine 2-epimerase  68.08 
 
 		 408 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1014  hypothetical protein  63.5 
 
 		 416 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1052  N-acylglucosamine 2-epimerase  64.81 
 
 		 417 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0420922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2629  N-acylglucosamine 2-epimerase  54.34 
 
 		 417 aa  395  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4598  N-acylglucosamine 2-epimerase  51.47 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00161711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  50.88 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03765  predicted glucosamine isomerase  47.39 
 
 		 413 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4106  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.39 
 
 		 413 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4403  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.39 
 
 		 413 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4265  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.39 
 
 		 413 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03714  hypothetical protein  47.39 
 
 		 413 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0790  N-acylglucosamine 2-epimerase  52.55 
 
 		 417 aa  368  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.942264  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1942  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.88 
 
 		 416 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4298  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.4 
 
 		 413 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4344  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.4 
 
 		 413 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.395722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4231  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.4 
 
 		 413 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4253  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.4 
 
 		 413 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4409  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.4 
 
 		 413 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5327  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.9 
 
 		 413 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.78432 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.38 
 
 		 425 aa  362  6e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1306  N-acylglucosamine 2-epimerase  53.42 
 
 		 404 aa  360  3e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  52.28 
 
 		 410 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  49.23 
 
 		 407 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  48.26 
 
 		 634 aa  327  3e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0269  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.71 
 
 		 417 aa  325  7e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.475155  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0388  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.91 
 
 		 424 aa  323  4e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10140  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  45.68 
 
 		 415 aa  319  6e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0199  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  42.05 
 
 		 411 aa  291  2e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552163  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4855  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.29 
 
 		 391 aa  286  5e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331313  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1762  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.6 
 
 		 418 aa  281  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0295295 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  42.17 
 
 		 435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.37 
 
 		 418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.08 
 
 		 418 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.77 
 
 		 414 aa  249  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.28 
 
 		 419 aa  243  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  37.56 
 
 		 418 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.01 
 
 		 419 aa  238  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.82 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.48 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.24 
 
 		 392 aa  160  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  31.74 
 
 		 401 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.16 
 
 		 427 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.25 
 
 		 408 aa  156  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.74 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.26 
 
 		 401 aa  155  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  34.06 
 
 		 470 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.14 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  33.33 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.15 
 
 		 412 aa  150  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.46 
 
 		 406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.89 
 
 		 426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.23 
 
 		 426 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.62 
 
 		 426 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  28.86 
 
 		 391 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.97 
 
 		 426 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.97 
 
 		 426 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.66 
 
 		 394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.08 
 
 		 426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.76 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  33.82 
 
 		 483 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.73 
 
 		 343 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  33.82 
 
 		 483 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  33.82 
 
 		 483 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  33.82 
 
 		 483 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  33.62 
 
 		 485 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  33.43 
 
 		 500 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  33.62 
 
 		 489 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  33.11 
 
 		 944 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.52 
 
 		 411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.3 
 
 		 419 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.03 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.33 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.99 
 
 		 408 aa  120  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.96 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  28.15 
 
 		 389 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.38 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3338  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.92 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0557801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.44 
 
 		 392 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.2 
 
 		 412 aa  57  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.27 
 
 		 377 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.27 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  25.86 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.85 
 
 		 366 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.44 
 
 		 404 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  29.03 
 
 		 404 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.39 
 
 		 396 aa  50.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2991  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.69 
 
 		 438 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1977  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.67 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057308  normal  0.460832 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  26.58 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.58 
 
 		 365 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1847  Mannose-6-phosphate isomerase  27.69 
 
 		 401 aa  47  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.38 
 
 		 377 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  26.07 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.02 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.04 
 
 		 416 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3294  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.72 
 
 		 394 aa  43.9  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3784  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.37 
 
 		 392 aa  43.5  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.039561  normal  0.0465307 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>