More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3975 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2100  two-component sensor protein  53.05 
 
 		 1211 aa  1194    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  0.142111 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1482  sensory box histidine kinase/response regulator  33.79 
 
 		 1213 aa  649    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2326  extracellular solute-binding protein/sensory box protein  62.5 
 
 		 751 aa  945    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163187  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1292  PAS  35.19 
 
 		 1209 aa  656    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.746783 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2113  PAS  58.96 
 
 		 1206 aa  1421    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.819255  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.24 
 
 		 1201 aa  1186    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278595  normal  0.0196406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1642  putative PAS/PAC sensor protein  55.6 
 
 		 796 aa  833    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0928458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3975  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1214 aa  2499    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0173  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 		 1191 aa  795    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1162  two-component sensor  41.67 
 
 		 1215 aa  857    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0303  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 		 1196 aa  777    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.723835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12820  two-component sensor  43.05 
 
 		 1212 aa  854    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3639  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.71 
 
 		 1210 aa  1188    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.847136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1420  sensory box histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 		 1199 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24720  putative two-component sensor  44.74 
 
 		 741 aa  525  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2094  virulence sensor protein BvgS  45.62 
 
 		 691 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2316  sensor histidine kinase/response regulator  54.85 
 
 		 477 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.857648  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5710  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase (bvgS-like)  32.36 
 
 		 1040 aa  495  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2657  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  29.62 
 
 		 1197 aa  490  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2520  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  30.88 
 
 		 1127 aa  491  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2739  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  29.54 
 
 		 1197 aa  492  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.485487  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02280  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  29.76 
 
 		 1197 aa  489  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1287  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.76 
 
 		 1197 aa  489  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1299  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  29.76 
 
 		 1197 aa  489  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2507  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  29.68 
 
 		 1197 aa  488  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0203632  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02241  hypothetical protein  29.76 
 
 		 1197 aa  489  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3601  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  30.35 
 
 		 1127 aa  486  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.317303 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1864  Hpt sensor hybrid histidine kinase  50.1 
 
 		 1069 aa  446  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2161  sensor histidine kinase/response regulator  29.29 
 
 		 1286 aa  438  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2782  Hpt sensor hybrid histidine kinase  46.45 
 
 		 1091 aa  416  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2349  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 		 1093 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0868194  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3413  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 		 1093 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.464366 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2527  Hpt sensor hybrid histidine kinase  46.73 
 
 		 1090 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120042  normal  0.0845157 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.49 
 
 		 1410 aa  352  3e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1612  histidine kinase  46.21 
 
 		 448 aa  348  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.786857  normal  0.263527 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 1165 aa  334  5e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4472  PAS  41.07 
 
 		 679 aa  333  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.185936  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.96 
 
 		 1199 aa  328  4.0000000000000003e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4410  virulence sensor protein BvgS  32.3 
 
 		 948 aa  316  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 		 1788 aa  315  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.49 
 
 		 1055 aa  302  3e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30700  putative sensor/response regulator hybrid  44.47 
 
 		 992 aa  291  6e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.716544  hitchhiker  0.000396049 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2957  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.24 
 
 		 810 aa  288  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.62 
 
 		 1049 aa  286  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 		 1127 aa  275  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2140  fused multi-sensor protein  34.86 
 
 		 882 aa  274  9e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.236911  normal  0.359885 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.42 
 
 		 772 aa  273  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 		 1029 aa  263  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.51 
 
 		 862 aa  261  7e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 1116 aa  260  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 		 803 aa  258  4e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  35.59 
 
 		 968 aa  256  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 		 781 aa  255  4.0000000000000004e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5844  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 		 948 aa  254  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 		 846 aa  254  6e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.59 
 
 		 1313 aa  251  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 		 1433 aa  251  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2187  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 		 705 aa  250  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1259  sensory box sensor histidine kinase/response regulator VieS  23.73 
 
 		 1146 aa  250  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 		 1622 aa  250  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 916 aa  249  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 		 1002 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 		 1177 aa  246  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 		 982 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2769  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 		 773 aa  246  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  37.66 
 
 		 651 aa  245  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4222  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.55 
 
 		 1002 aa  244  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480663  normal  0.970552 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 764 aa  244  7e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 		 1003 aa  244  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  37.86 
 
 		 742 aa  243  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  32.62 
 
 		 794 aa  243  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.83 
 
 		 882 aa  243  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  37.47 
 
 		 882 aa  244  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4228  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.74 
 
 		 1011 aa  244  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.59 
 
 		 785 aa  243  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  37.78 
 
 		 620 aa  243  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.29 
 
 		 743 aa  242  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1407 aa  242  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 1767 aa  242  4e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 1767 aa  241  5e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 		 827 aa  241  6.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1627  two-component system sensor protein  36.57 
 
 		 988 aa  241  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255919  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.13 
 
 		 1199 aa  241  8e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  37.59 
 
 		 641 aa  241  9e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.96 
 
 		 1611 aa  240  9e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  37.1 
 
 		 651 aa  240  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2366  histidine kinase  39.75 
 
 		 697 aa  240  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 		 896 aa  240  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0180  response regulator/sensor histidine kinase  36.57 
 
 		 1014 aa  240  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.696748  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  36.57 
 
 		 1032 aa  240  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.16 
 
 		 863 aa  239  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 		 969 aa  240  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0331  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.46 
 
 		 843 aa  239  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 		 1078 aa  239  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2154  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.12 
 
 		 815 aa  239  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2504  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.81 
 
 		 1132 aa  239  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 		 1582 aa  238  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  35.71 
 
 		 1023 aa  238  5.0000000000000005e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.35 
 
 		 1195 aa  238  5.0000000000000005e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  31.33 
 
 		 606 aa  238  6e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>