282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4637 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 348 aa  711    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  67.35 
 
 		 348 aa  485  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2310  ornithine cyclodeaminase  66.76 
 
 		 357 aa  483  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  65.12 
 
 		 358 aa  476  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  64.24 
 
 		 358 aa  474  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  66.96 
 
 		 351 aa  472  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  63.95 
 
 		 358 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  67.56 
 
 		 346 aa  463  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1826  ornithine cyclodeaminase  66.37 
 
 		 348 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0818246  normal  0.659466 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  63.99 
 
 		 350 aa  448  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1216  ornithine cyclodeaminase  64.41 
 
 		 350 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  58.38 
 
 		 354 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  57.78 
 
 		 354 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  58.81 
 
 		 358 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1795  ornithine cyclodeaminase  55.36 
 
 		 366 aa  392  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.419928  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  56.29 
 
 		 349 aa  388  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3883  ornithine cyclodeaminase  57.31 
 
 		 369 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  55.52 
 
 		 350 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  56.8 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  56.97 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  54.93 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  55.52 
 
 		 350 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0121  ornithine cyclodeaminase  56.64 
 
 		 382 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0279  ornithine cyclodeaminase  56.29 
 
 		 349 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.815207 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  54.19 
 
 		 340 aa  369  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2671  ornithine cyclodeaminase  54.87 
 
 		 359 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  55.33 
 
 		 353 aa  361  1e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3030  ornithine cyclodeaminase  58.13 
 
 		 334 aa  360  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2542  ornithine cyclodeaminase  56.63 
 
 		 359 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0586  ornithine cyclodeaminase  56.8 
 
 		 362 aa  360  2e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.766094  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2802  ornithine cyclodeaminase  57.4 
 
 		 343 aa  360  3e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.937612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2926  ornithine cyclodeaminase  57.88 
 
 		 343 aa  358  5e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.438902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4693  ornithine cyclodeaminase  55.72 
 
 		 349 aa  358  6e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3492  ornithine cyclodeaminase  55.72 
 
 		 359 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  53.1 
 
 		 357 aa  355  5e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3943  ornithine cyclodeaminase  55.42 
 
 		 359 aa  351  8e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0586  ornithine cyclodeaminase  56.5 
 
 		 366 aa  352  8e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4333  ornithine cyclodeaminase  58.31 
 
 		 352 aa  351  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5311  ornithine cyclodeaminase  55.12 
 
 		 359 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3577  ornithine cyclodeaminase  55.12 
 
 		 359 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0592  ornithine cyclodeaminase  55.39 
 
 		 350 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2754  ornithine cyclodeaminase  47.48 
 
 		 339 aa  330  2e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0613  ornithine cyclodeaminase  57.23 
 
 		 328 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  43.94 
 
 		 336 aa  293  4e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  43.94 
 
 		 336 aa  293  4e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  43.15 
 
 		 345 aa  271  1e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  34.07 
 
 		 326 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  33.45 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  32.58 
 
 		 324 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  31.15 
 
 		 326 aa  132  9e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  32.47 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  29.9 
 
 		 324 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  35.88 
 
 		 302 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  34.73 
 
 		 329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  33.01 
 
 		 319 aa  122  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  32.84 
 
 		 320 aa  119  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  33.87 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  34.5 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  36.44 
 
 		 313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  33.47 
 
 		 325 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  33.07 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  33.07 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  33.07 
 
 		 325 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  31.18 
 
 		 325 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  33.71 
 
 		 325 aa  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  30.83 
 
 		 316 aa  112  7.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  33.47 
 
 		 325 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  33.07 
 
 		 325 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  33.71 
 
 		 330 aa  112  8.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  33.46 
 
 		 331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  34.16 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  32.4 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 338 aa  109  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  34.12 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  32.27 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  34.26 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  34.57 
 
 		 326 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  30.19 
 
 		 338 aa  106  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.94 
 
 		 351 aa  103  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  31.52 
 
 		 319 aa  103  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  34.05 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  31.37 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  32.53 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  31.85 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  29.76 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  35.74 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  30.55 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  32.09 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  31.51 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  32.22 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  30.12 
 
 		 329 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  32.9 
 
 		 332 aa  100  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  27.92 
 
 		 340 aa  100  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  33.47 
 
 		 313 aa  99.4  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  32.81 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  32.38 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  33.47 
 
 		 314 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2564  Ornithine cyclodeaminase  36.16 
 
 		 312 aa  97.8  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0450011  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  30.35 
 
 		 315 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  30.74 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>