More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3018 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3018  ABC transporter related  100 
 
 		 595 aa  1168    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1441  ABC transporter related  53.98 
 
 		 606 aa  600  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  50.61 
 
 		 600 aa  588  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2442  ABC transporter related  59.76 
 
 		 634 aa  547  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0403227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1572  ABC transporter related protein  45.42 
 
 		 591 aa  451  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.722294  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  39.29 
 
 		 581 aa  335  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  39.32 
 
 		 607 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  38.81 
 
 		 577 aa  325  2e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  39.25 
 
 		 576 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  34.51 
 
 		 579 aa  316  9e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  40.78 
 
 		 593 aa  314  2.9999999999999996e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  36.59 
 
 		 581 aa  309  8e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.98 
 
 		 581 aa  308  1.0000000000000001e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  38.1 
 
 		 596 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  37.05 
 
 		 581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4045  ABC transporter related  37.68 
 
 		 582 aa  308  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  37.01 
 
 		 583 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  36.2 
 
 		 587 aa  305  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4444  ABC transporter related  36.5 
 
 		 577 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2339  ABC transporter component  38.65 
 
 		 582 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667532  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  35.23 
 
 		 588 aa  303  8.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  35.43 
 
 		 593 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.2 
 
 		 577 aa  301  3e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  36.35 
 
 		 584 aa  295  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.7 
 
 		 581 aa  294  3e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  36 
 
 		 611 aa  292  9e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  36.98 
 
 		 600 aa  291  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  34.71 
 
 		 590 aa  288  2e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.97 
 
 		 577 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  34.33 
 
 		 1228 aa  287  4e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.89 
 
 		 588 aa  286  5e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  35.84 
 
 		 578 aa  286  9e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 		 581 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  36.62 
 
 		 577 aa  286  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  30.41 
 
 		 587 aa  284  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  30.41 
 
 		 587 aa  284  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  37.17 
 
 		 578 aa  284  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  34.38 
 
 		 574 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  35.28 
 
 		 585 aa  283  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.46 
 
 		 581 aa  282  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  39 
 
 		 579 aa  282  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  35.88 
 
 		 598 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  31.45 
 
 		 578 aa  282  1e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  31.45 
 
 		 578 aa  282  1e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.28 
 
 		 585 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  35.71 
 
 		 577 aa  281  2e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  35.52 
 
 		 571 aa  281  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  33.2 
 
 		 579 aa  280  4e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  34.39 
 
 		 579 aa  279  8e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  40.28 
 
 		 595 aa  279  8e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.75 
 
 		 597 aa  279  1e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  36.9 
 
 		 593 aa  278  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.7 
 
 		 580 aa  278  3e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  37.78 
 
 		 618 aa  278  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  35.84 
 
 		 619 aa  277  4e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.63 
 
 		 579 aa  276  5e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  35.09 
 
 		 575 aa  276  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.06 
 
 		 593 aa  275  1.0000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  37.5 
 
 		 635 aa  275  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  32.21 
 
 		 577 aa  275  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  33.33 
 
 		 581 aa  275  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  35.57 
 
 		 640 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  32.21 
 
 		 577 aa  275  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  37.76 
 
 		 608 aa  274  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.43 
 
 		 585 aa  274  3e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  34.36 
 
 		 584 aa  274  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  35.73 
 
 		 604 aa  274  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  36.31 
 
 		 600 aa  274  3e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.37 
 
 		 589 aa  273  5.000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.51 
 
 		 581 aa  273  7e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  35.14 
 
 		 574 aa  273  8.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1494  ABC transporter related  35.14 
 
 		 647 aa  272  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  36.77 
 
 		 655 aa  273  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  36 
 
 		 579 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4419  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.33 
 
 		 581 aa  270  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.32 
 
 		 603 aa  270  5.9999999999999995e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  38.53 
 
 		 622 aa  268  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  34.22 
 
 		 578 aa  268  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  34.22 
 
 		 578 aa  268  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0689  ABC transporter related  37.07 
 
 		 644 aa  267  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366434  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1909  ABC transporter related  37.91 
 
 		 672 aa  266  5.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0882  ABC transporter, transmembrane region  35.48 
 
 		 592 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5208  ABC transporter related  36.64 
 
 		 663 aa  266  7e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.670373  normal  0.309398 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.27 
 
 		 581 aa  266  7e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.74 
 
 		 577 aa  266  7e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  33.27 
 
 		 597 aa  265  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.95 
 
 		 578 aa  265  2e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  35.62 
 
 		 642 aa  265  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.86 
 
 		 572 aa  264  3e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1491  ABC transporter related  34.76 
 
 		 584 aa  264  3e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4741  ABC transporter related  36.44 
 
 		 662 aa  264  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.13 
 
 		 582 aa  264  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  35.17 
 
 		 581 aa  262  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  32.26 
 
 		 592 aa  262  1e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  46.58 
 
 		 582 aa  261  2e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1890  ABC transporter related  37.95 
 
 		 607 aa  262  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124056  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  32.14 
 
 		 602 aa  261  3e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.33 
 
 		 568 aa  261  4e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.65 
 
 		 574 aa  260  4e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  34.73 
 
 		 606 aa  260  4e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>