More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0798 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  100 
 
 		 286 aa  589  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  75.17 
 
 		 286 aa  447  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1768  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  72.73 
 
 		 286 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0414  aminotransferase, class IV  72.38 
 
 		 286 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  73.08 
 
 		 286 aa  432  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  68.29 
 
 		 284 aa  386  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0363  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  67.48 
 
 		 285 aa  382  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4609  aminotransferase class IV  61.62 
 
 		 288 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.296003  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0536  aminotransferase class IV  62.46 
 
 		 284 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3455  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  61.67 
 
 		 285 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3100  aminotransferase, class IV  61.32 
 
 		 285 aa  351  7e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712487 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1208  aminotransferase class IV  62.02 
 
 		 284 aa  349  4e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.621738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  56.79 
 
 		 286 aa  334  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1218  aminotransferase class IV  56.63 
 
 		 286 aa  328  4e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3425  aminotransferase, class IV  55.75 
 
 		 285 aa  328  7e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2788  aminotransferase class IV  56.27 
 
 		 286 aa  328  8e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  55.44 
 
 		 293 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  55.44 
 
 		 293 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  54.29 
 
 		 286 aa  311  6.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  54.29 
 
 		 287 aa  310  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2868  aminotransferase class IV  54.64 
 
 		 286 aa  310  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1427  D-amino acid aminotransferase  55.44 
 
 		 293 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  54.84 
 
 		 285 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  53.9 
 
 		 285 aa  300  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  55.44 
 
 		 288 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  54.64 
 
 		 282 aa  296  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  52.98 
 
 		 285 aa  296  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6843  aminotransferase class IV  56.07 
 
 		 282 aa  295  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  52.63 
 
 		 285 aa  294  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  52.33 
 
 		 290 aa  286  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  51.79 
 
 		 290 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  51.79 
 
 		 290 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1647  D-amino acid aminotransferase  52.6 
 
 		 286 aa  275  9e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  48.07 
 
 		 286 aa  271  9e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3562  aminotransferase class IV  49.46 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2359  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  49.65 
 
 		 285 aa  263  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.74058  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  47.57 
 
 		 287 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.68 
 
 		 288 aa  257  1e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  42.91 
 
 		 288 aa  247  1e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  44.95 
 
 		 288 aa  238  5.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  43.42 
 
 		 303 aa  238  8e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  46.74 
 
 		 285 aa  234  9e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  43.01 
 
 		 286 aa  233  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  44.13 
 
 		 286 aa  231  7.000000000000001e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  47 
 
 		 281 aa  229  5e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  45.52 
 
 		 285 aa  226  4e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  44.44 
 
 		 285 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  46.24 
 
 		 285 aa  224  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  44.09 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  40.28 
 
 		 287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5171  aminotransferase class IV  45.39 
 
 		 283 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623088  normal  0.871234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  44.8 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  42.86 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  40.28 
 
 		 287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  44.44 
 
 		 285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  40.91 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  37.86 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1682  D-amino acid aminotransferase  43.46 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3125  aminotransferase class IV  40.86 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.427478 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  38.19 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  39.3 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  39.86 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.52 
 
 		 282 aa  191  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.73 
 
 		 291 aa  189  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  37 
 
 		 282 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  37 
 
 		 282 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.88 
 
 		 282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  38.71 
 
 		 283 aa  182  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  38.01 
 
 		 304 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0312  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.79 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381931  hitchhiker  0.00369905 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  36.13 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.14 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  37.77 
 
 		 282 aa  176  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  36.73 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.36 
 
 		 286 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  37.94 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  40.07 
 
 		 303 aa  172  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  35.71 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  34.39 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.99 
 
 		 300 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  37.01 
 
 		 297 aa  168  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  34.43 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4217  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.93 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.754145 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  35.66 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0499  aminotransferase class IV  36.43 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  35.66 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0660  D-amino acid aminotransferase  33.81 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.574583  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  35.66 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  35.66 
 
 		 291 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  35.29 
 
 		 291 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  35.29 
 
 		 291 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6235  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.68 
 
 		 308 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.513933 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  33.09 
 
 		 293 aa  162  9e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0246  aminotransferase, class IV  34.03 
 
 		 303 aa  162  9e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  35.29 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  34.91 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  35.46 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0412  aminotransferase class IV  36.96 
 
 		 308 aa  159  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11828  normal  0.0157009 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  35.04 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  35.27 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>