More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2878 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  411  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  64.5 
 
 		 202 aa  277  7e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  64.5 
 
 		 202 aa  277  7e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  64.5 
 
 		 202 aa  277  7e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  64.5 
 
 		 202 aa  277  7e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  64 
 
 		 202 aa  274  6e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  66.16 
 
 		 202 aa  272  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  60.1 
 
 		 202 aa  254  7e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 202 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1307  transcriptional regulator, TetR family  63 
 
 		 202 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1915  transcriptional regulator, TetR family  63.08 
 
 		 200 aa  243  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  55.72 
 
 		 202 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  53.47 
 
 		 202 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1022  transcriptional regulator, TetR family  65.15 
 
 		 202 aa  226  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1240  TetR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 201 aa  215  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 201 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 203 aa  201  6e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1362  TetR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 139 aa  194  9e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  45.88 
 
 		 199 aa  191  5e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3094  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3622  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3254  TetR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 199 aa  138  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2838  hypothetical protein  41.26 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209272 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 199 aa  99  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 200 aa  94.4  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 196 aa  84.7  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2389  nucleoid occlusion protein  30.99 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.102395  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 181 aa  74.7  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1903  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000201758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3302  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.696216 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0620  nucleoid occlusion protein  28.3 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000140669 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6449  nucleoid occlusion protein  33.06 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.695285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3114  nucleoid occlusion protein  32.56 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2484  nucleoid occlusion protein  32.56 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.11022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3098  nucleoid occlusion protein  32.56 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170288  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1117  nucleoid occlusion protein  28.3 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.862438  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3007  nucleoid occlusion protein  31.4 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.8305 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3145  nucleoid occlusion protein  31.62 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  28.3 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2012  nucleoid occlusion protein  29.55 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0336  nucleoid occlusion protein  30.4 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3543  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0364286 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1012  hypothetical protein  30.43 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0378  nucleoid occlusion protein  31.4 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.99909  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00047  nucleoid occlusion protein  26.97 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3247  nucleoid occlusion protein  31.4 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0194  nucleoid occlusion protein  26.38 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0158  nucleoid occlusion protein  31.4 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3674  nucleoid occlusion protein  25.86 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00408157  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4387  nucleoid occlusion protein  30.4 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.449333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1729  nucleoid occlusion protein  29.55 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3440  nucleoid occlusion protein  31.4 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2908  nucleoid occlusion protein  31.4 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.946505  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2181  nucleoid occlusion protein  31.4 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  27.95 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0183  nucleoid occlusion protein  31.4 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.24476  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0193  nucleoid occlusion protein  31.4 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2985  nucleoid occlusion protein  28.57 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.111899  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  28.15 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  22.09 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0062  nucleoid occlusion protein  28.03 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249336  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0031  nucleoid occlusion protein  26.42 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3719  nucleoid occlusion protein  27.04 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3396  nucleoid occlusion protein  27.04 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001824  transcriptional regulator  27.67 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000410739  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0182  nucleoid occlusion protein  27.54 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847466  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3094  nucleoid occlusion protein  26.14 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.483047 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0111  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00780937  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3521  nucleoid occlusion protein  31.33 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0044  nucleoid occlusion protein  25.93 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00442405  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3502  nucleoid occlusion protein  27.22 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.284468  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0542  nucleoid occlusion protein  22.4 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00651  nucleoid occlusion protein  27.21 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0382  nucleoid occlusion protein  23.49 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000135011  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4564  nucleoid occlusion protein  22.89 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000269162  unclonable  0.0000000294752 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3840  nucleoid occlusion protein  22.42 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00664895  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 257 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0501  nucleoid occlusion protein  22.89 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.957497  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0385  nucleoid occlusion protein  24.1 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000224895  hitchhiker  0.00861349 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0399  nucleoid occlusion protein  24.1 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0627309  hitchhiker  0.000000000130483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>